More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0108 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0108  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
477 aa  964    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1811  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 
477 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.497016  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2250  glutamyl-tRNA synthetase  56.62 
 
 
472 aa  510  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.000000000347292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0510  glutamyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
466 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0935  glutamyl-tRNA synthetase  60.26 
 
 
468 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.355577  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
465 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 
465 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1916  glutamyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 
475 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2222  glutamyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 
508 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.493461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1876  glutamyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 
482 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000140035  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
485 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
482 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
485 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
488 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
481 aa  335  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
486 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
478 aa  322  7e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.67 
 
 
546 aa  321  9.999999999999999e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
485 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
484 aa  317  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
491 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
491 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
484 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
491 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
484 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 
488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  38.1 
 
 
518 aa  302  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
490 aa  302  9e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
490 aa  301  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
469 aa  297  4e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 
479 aa  295  8e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
463 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
499 aa  295  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
477 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
493 aa  292  7e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
463 aa  292  9e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
466 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
492 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
465 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 
466 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
469 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
469 aa  291  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
463 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
459 aa  290  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 
469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
500 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
470 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
462 aa  288  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
466 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
472 aa  288  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 
468 aa  288  2e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
473 aa  287  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
472 aa  286  5e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
464 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.4 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
492 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  286  7e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0986  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  38.65 
 
 
445 aa  285  8e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.159101  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
501 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
469 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
483 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
484 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
484 aa  281  1e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
471 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
471 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
471 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
471 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
501 aa  282  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
471 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
466 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
463 aa  281  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 
468 aa  280  4e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
485 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 
475 aa  279  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.77 
 
 
495 aa  279  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>