42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2648 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  668    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  40.3 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  30.71 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  28.74 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  24.71 
 
 		 331 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  30.04 
 
 		 278 aa  91.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  28.2 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  28.46 
 
 		 277 aa  85.9  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  31.61 
 
 		 642 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  29.07 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  30.4 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  29.96 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  27.86 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  27.07 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  23.02 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  29.39 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  26.54 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.62 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.84 
 
 		 299 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.59 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.87 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  27.94 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  20.9 
 
 		 445 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.32 
 
 		 498 aa  46.2  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.3 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  28.03 
 
 		 446 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  30.51 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.38 
 
 		 2122 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.75 
 
 		 668 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  27.27 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  30.4 
 
 		 438 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  33.05 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0044  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.28 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  31.03 
 
 		 281 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  25.55 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3974  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.82 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4017  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.82 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  31.9 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.4 
 
 		 493 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1682 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>