21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1476 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1008    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  34.26 
 
 
504 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  31.73 
 
 
513 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  32.28 
 
 
516 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  23.84 
 
 
508 aa  68.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  22.94 
 
 
504 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  23.49 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  20.89 
 
 
424 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  24.51 
 
 
353 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  34.41 
 
 
282 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  21.43 
 
 
440 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  21.35 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  24.06 
 
 
468 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  31.91 
 
 
283 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  24.74 
 
 
576 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  22.56 
 
 
286 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  19.76 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  20.69 
 
 
323 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  23.55 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  23.84 
 
 
296 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  25.35 
 
 
292 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>