40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0564 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  91.61 
 
 
477 aa  907    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  981    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  28.1 
 
 
496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  27.05 
 
 
568 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  24.47 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  25.7 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  24.29 
 
 
526 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  25.05 
 
 
525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  25 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  23.67 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  25 
 
 
534 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  23.8 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0800  hypothetical protein  26.72 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1222  hypothetical protein  24.9 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  28.11 
 
 
523 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  27.21 
 
 
527 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1154  gp33 TerL  24.33 
 
 
540 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.041853  hitchhiker  0.000000000115818 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  29.94 
 
 
426 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1828  hypothetical protein  25.71 
 
 
531 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0142111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  27.84 
 
 
476 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  27.84 
 
 
476 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  29.7 
 
 
452 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  27.56 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  25.08 
 
 
539 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  31.61 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  29.09 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  26 
 
 
504 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3801  hypothetical protein  27.06 
 
 
507 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  28.74 
 
 
260 aa  53.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  24.11 
 
 
421 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  26.29 
 
 
194 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1909  hypothetical protein  27.06 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00480674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0917  hypothetical protein  26.61 
 
 
507 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0745542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  26.04 
 
 
478 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  26.04 
 
 
503 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  26.04 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1625  prophage, terminase, ATPase subunit, putative  24.6 
 
 
599 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  38.96 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  29.19 
 
 
482 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  26.45 
 
 
523 aa  45.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>