More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1289 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1289  elongation factor P  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0131068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0466  elongation factor P  79.26 
 
 		 188 aa  320  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04017  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3845  translation elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3865  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.334824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4616  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4704  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4731  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4604  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4612  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5663  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4752  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.69408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4389  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03979  hypothetical protein  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4677  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4695  elongation factor P  73.94 
 
 		 188 aa  295  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03678  elongation factor P  72.34 
 
 		 189 aa  291  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3282  translation elongation factor P  70.21 
 
 		 189 aa  289  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002232  translation elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  288  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3818  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  287  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.145028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3672  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  287  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0719  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  287  5.0000000000000004e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00137  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0333  elongation factor P  71.28 
 
 		 188 aa  284  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2234  elongation factor P  70.74 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0441  elongation factor P  69.15 
 
 		 189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  69.15 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0412  elongation factor P  67.02 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3943  elongation factor P  67.02 
 
 		 188 aa  275  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.359107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0972  translation elongation factor P  67.2 
 
 		 191 aa  273  8e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3765  elongation factor P  65.96 
 
 		 188 aa  271  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2792  elongation factor P  67.02 
 
 		 188 aa  269  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1680  elongation factor P  63.16 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2626  elongation factor P  64.36 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1950  elongation factor P  63.49 
 
 		 190 aa  267  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  65.59 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1741  translation elongation factor P  64.89 
 
 		 188 aa  264  5.999999999999999e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  65.43 
 
 		 189 aa  262  3e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1320  elongation factor P  63.3 
 
 		 188 aa  261  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2782  elongation factor P  65.08 
 
 		 191 aa  261  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0486  elongation factor P  61.9 
 
 		 191 aa  260  6.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2531  translation elongation factor P (EF-P)  63.64 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0465  translation elongation factor P  61.5 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.754261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0365  elongation factor P  61.17 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0340  elongation factor P  61.7 
 
 		 189 aa  248  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1232  translation elongation factor P  64.71 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.120458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1576  elongation factor P  61.17 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2015  elongation factor P  57.45 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0045  elongation factor P  57.45 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1633  elongation factor P  61.17 
 
 		 187 aa  242  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1979  elongation factor P  59.04 
 
 		 189 aa  241  3e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0589  translation elongation factor P  58.2 
 
 		 189 aa  238  4e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.14592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0899  translation elongation factor P  58.82 
 
 		 191 aa  234  7e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2742  elongation factor P  60.11 
 
 		 188 aa  225  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.4562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00382  elongation factor P  59.89 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1752  elongation factor P  47.57 
 
 		 187 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000421728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  44.09 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2147  elongation factor P  45.95 
 
 		 187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000102512  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0948  translation elongation factor P (EF-P)  44.57 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103286  decreased coverage  0.000108298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4171  translation elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.374404  normal  0.818087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1838  elongation factor P  45.41 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1763  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00363755  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0133  elongation factor P  45.74 
 
 		 190 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00102096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  44.32 
 
 		 187 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  44.32 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1913  elongation factor P  44.57 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000066721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  46.15 
 
 		 185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  44.09 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  46.77 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2544  translation elongation factor P  44.81 
 
 		 186 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0481189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  44.51 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1052  translation elongation factor P  45.9 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000883108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07870  translation elongation factor P  42.78 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.884317  hitchhiker  0.00530797 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  44.62 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2489  elongation factor P  42.93 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  45.11 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12554  elongation factor P  45.65 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0185944 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  43.72 
 
 		 185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  43.17 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1717  translation elongation factor P (EF-P)  44.57 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0425827 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1570  elongation factor P  45.16 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  44.68 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05180  translation elongation factor P (EF-P)  43.72 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5249  translation elongation factor P  45.36 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  43.24 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  44.51 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  45.05 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1523  elongation factor P  42.22 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  44.86 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  42.7 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  45.6 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  45.05 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  45.05 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  43.17 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  41.76 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>