More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0054 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  100 
 
 		 313 aa  637    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1444  thioredoxin reductase  58.21 
 
 		 339 aa  391  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3717  thioredoxin reductase  60.78 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.00183833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4503  thioredoxin reductase  59.48 
 
 		 346 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.219362  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  60.52 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4161  thioredoxin reductase  57.23 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.307371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14640  thioredoxin-disulfide reductase  58.52 
 
 		 332 aa  371  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  59.8 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2547  thioredoxin reductase  57.76 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.788713  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3928  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37940  thioredoxin-disulfide reductase  58.88 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  57.98 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31890  thioredoxin-disulfide reductase  56.73 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  56.17 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  57.61 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3368  thioredoxin reductase  57.38 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  58.82 
 
 		 310 aa  362  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  60.19 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9042  thioredoxin reductase  58.77 
 
 		 317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  55.84 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  59.09 
 
 		 325 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  57.52 
 
 		 348 aa  348  5e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  57.61 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 333 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  56.82 
 
 		 319 aa  343  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  55.45 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  57 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  54.22 
 
 		 314 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  54.22 
 
 		 314 aa  341  8e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4687  thioredoxin reductase  57.14 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.323134  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3650  thioredoxin reductase  60.53 
 
 		 327 aa  338  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 331 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  53.63 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39670  thioredoxin-disulfide reductase  54.34 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.388089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  58.96 
 
 		 325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  54.22 
 
 		 311 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0214  thioredoxin reductase  56.68 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  57.19 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  55.48 
 
 		 318 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  53.72 
 
 		 335 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 317 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 312 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 311 aa  331  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  54.28 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  52.27 
 
 		 311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  56.03 
 
 		 348 aa  328  8e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2148  thioredoxin reductase  56.27 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  55.59 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  55.3 
 
 		 332 aa  325  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  53.4 
 
 		 330 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  53.18 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  51.77 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  53.57 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 321 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 334 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  53.62 
 
 		 321 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  51.3 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 316 aa  322  6e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  53.95 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  51.59 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  51.13 
 
 		 325 aa  318  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 321 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  53.95 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2145  thioredoxin reductase  53.07 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.610006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  51.29 
 
 		 324 aa  315  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  52.96 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  54.9 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  49.67 
 
 		 331 aa  312  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  50.65 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  50.48 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  50.48 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  49.37 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  54.45 
 
 		 325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3815  thioredoxin reductase  51.15 
 
 		 316 aa  309  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0152515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  53.29 
 
 		 314 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2343  thioredoxin reductase  50.49 
 
 		 322 aa  308  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  47.94 
 
 		 317 aa  308  9e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  52.6 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  49.36 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2812  thioredoxin reductase  49.34 
 
 		 326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2305  thioredoxin reductase  51.59 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  49.36 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  51.31 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  54.1 
 
 		 320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  49.68 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5827  thioredoxin reductase  52.13 
 
 		 325 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0638947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  49.84 
 
 		 361 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0887  thioredoxin reductase  50.79 
 
 		 320 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2654  thioredoxin reductase  48.23 
 
 		 332 aa  305  9.000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  46.35 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>