More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3188 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
313 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  30.62 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  41.74 
 
 
292 aa  92  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  25.17 
 
 
708 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
294 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
311 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
348 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  38.26 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
581 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
727 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  27.6 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
983 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  39.29 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
1035 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.97 
 
 
411 aa  79.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
337 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  35.59 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.46 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.16 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.9 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.56 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.11 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.11 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 
373 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.82 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.35 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.06 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
746 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.91 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
1124 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
812 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.69 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.91 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  26.94 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.08 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.19 
 
 
851 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  37.76 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  33.62 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.05 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  41.05 
 
 
1157 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.97 
 
 
694 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.19 
 
 
851 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.19 
 
 
851 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  24.77 
 
 
613 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  34.74 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
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NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  32.19 
 
 
851 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.19 
 
 
851 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  23.98 
 
 
623 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  24.77 
 
 
613 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 
613 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_1747  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
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