23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3076 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3076  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1108 aa  2259    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0439  Tetratricopeptide domain protein  72.33 
 
 		 1090 aa  1499    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0542  hypothetical protein  37.58 
 
 		 922 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  39.93 
 
 		 941 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3566  coenzyme A biosynthesis protein  31.24 
 
 		 957 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1813  TPR repeat-containing protein  32.51 
 
 		 952 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  29.72 
 
 		 952 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1601  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 939 aa  247  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1229  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 1016 aa  238  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.748097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3961  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.63 
 
 		 1058 aa  117  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.357683  normal  0.258592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3466  TPR repeat-containing protein  20.15 
 
 		 1191 aa  94.7  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3386  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 1162 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3402  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.92 
 
 		 1192 aa  92  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3322  TPR repeat-containing protein  19.81 
 
 		 1193 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2491  Tetratricopeptide repeat protein  18.56 
 
 		 1155 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.694417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 1077 aa  56.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  21.8 
 
 		 1000 aa  50.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.59 
 
 		 248 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6495  Tetratricopeptide repeat protein  23.51 
 
 		 1202 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  36.76 
 
 		 245 aa  47.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 864 aa  46.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0544  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.89 
 
 		 1077 aa  45.4  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000321228  normal  0.11155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  20.15 
 
 		 1004 aa  45.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>