34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2741 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2741  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1139    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000033035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5058  hypothetical protein  27.65 
 
 
564 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2826  hypothetical protein  26.56 
 
 
659 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.16509  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4211  hypothetical protein  33.81 
 
 
323 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.755848  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1631  hypothetical protein  25.38 
 
 
594 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000289868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1573  hypothetical protein  25.68 
 
 
558 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.580118  normal  0.207825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2639  hypothetical protein  25.31 
 
 
573 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0014587  decreased coverage  1.98155e-17 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4527  hypothetical protein  30.74 
 
 
427 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  25.84 
 
 
884 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0910  hypothetical protein  25.66 
 
 
570 aa  99  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2605  hypothetical protein  35.32 
 
 
583 aa  98.2  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0570  hypothetical protein  25.17 
 
 
621 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407962  normal  0.128274 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0685  hypothetical protein  23.86 
 
 
571 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1444  hypothetical protein  27.91 
 
 
583 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1808  hypothetical protein  28.43 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00269931  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0767  abortive infection phage resistance protein  28.44 
 
 
567 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2699  Abortive phage infection  27.34 
 
 
571 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.664901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2679  hypothetical protein  26.75 
 
 
554 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000692051  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0195  hypothetical protein  28.96 
 
 
589 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.520308  normal  0.0593303 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1231  Abortive phage infection  28.57 
 
 
567 aa  62.4  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0311  hypothetical protein  22.36 
 
 
628 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1771  hypothetical protein  31.97 
 
 
591 aa  60.8  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1325  hypothetical protein  25.58 
 
 
564 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2090  hypothetical protein  25.86 
 
 
600 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0662343  normal  0.183735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1573  hypothetical protein  24.05 
 
 
324 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1326  hypothetical protein  23.79 
 
 
588 aa  55.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0341  hypothetical protein  26.84 
 
 
599 aa  54.3  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4170  hypothetical protein  22.29 
 
 
571 aa  53.9  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2265  hypothetical protein  25.45 
 
 
708 aa  52.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0442234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2370  hypothetical protein  26.8 
 
 
706 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2523  hypothetical protein  39.47 
 
 
572 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4269  hypothetical protein  26.79 
 
 
654 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2746  hypothetical protein  25.26 
 
 
699 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3657  abortive infection phage resistance protein, putative  33.33 
 
 
583 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00483557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>