More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2472 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2472  aminotransferase, class V  100 
 
 		 377 aa  772    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0835  aminotransferase class V  58.82 
 
 		 377 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.723233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2786  cysteine desulfurase  56.8 
 
 		 378 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0169  cysteine desulfurase DndA  55.2 
 
 		 383 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  46.79 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  46.79 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  46.79 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 407 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  46.17 
 
 		 407 aa  318  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  46.79 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  46.79 
 
 		 407 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  46.58 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  45.38 
 
 		 389 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02508  cysteine desulfurase, alanine biosynthesis, putative (Eurofung)  45.26 
 
 		 507 aa  317  2e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  44.33 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  46.84 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  45.65 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  45.14 
 
 		 407 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1875  cysteine desulfurase  46.32 
 
 		 407 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  45.14 
 
 		 421 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 404 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  46.36 
 
 		 399 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  46.26 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  45.78 
 
 		 404 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  44.95 
 
 		 404 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.85 
 
 		 388 aa  312  5.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  45 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  43.8 
 
 		 388 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  44.85 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  45.67 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45194  predicted protein  44.6 
 
 		 395 aa  309  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0622302  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  45.14 
 
 		 404 aa  308  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  47.41 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  44.59 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  45.63 
 
 		 405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  44.88 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  45.78 
 
 		 404 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0717  cysteine desulfurase  43.85 
 
 		 406 aa  305  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  43.8 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  43.8 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  45.36 
 
 		 405 aa  305  8.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  45.41 
 
 		 502 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  44.41 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 404 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  45.26 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1487  cysteine desulfurase IscS  45.67 
 
 		 406 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000124631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  45.36 
 
 		 406 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  46.96 
 
 		 381 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  44.29 
 
 		 404 aa  299  6e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2290  cysteine desulfurase IscS  44.62 
 
 		 405 aa  299  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00326388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  43.87 
 
 		 404 aa  298  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 404 aa  298  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0808  cysteine desulfurase IscS  44.33 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000772731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  44.69 
 
 		 404 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2059  cysteine desulfurase IscS  45.14 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0733618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  44.2 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1164  cysteine desulfurase IscS  45.65 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000196201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0303  cysteine desulfurase  43.92 
 
 		 402 aa  296  4e-79  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  44.99 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0629  cysteine desulfurase  44.75 
 
 		 410 aa  295  6e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85588  predicted protein  45.55 
 
 		 493 aa  295  8e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.464986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  45.23 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0247  cysteine desulfurase  46.03 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  43.57 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 436 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  43.28 
 
 		 403 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  44.72 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  44.72 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 436 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  42.93 
 
 		 384 aa  293  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  43.01 
 
 		 403 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>