23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1843 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  100 
 
 		 513 aa  1063    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  42.08 
 
 		 290 aa  163  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  43.6 
 
 		 316 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  35.19 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  43.57 
 
 		 775 aa  123  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  40.38 
 
 		 482 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  39.35 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  33.17 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  33.77 
 
 		 553 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  37.34 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  29.03 
 
 		 324 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  34.9 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  28.95 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  34.51 
 
 		 830 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  30.72 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1149 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  29.94 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  39.08 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  43.33 
 
 		 992 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1046 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  31.63 
 
 		 859 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  29.81 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  41.67 
 
 		 900 aa  44.3  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>