35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1813 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1813  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2029  putative lipoprotein  45.6 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0974  putative type IV pilus assembly protein PilP  48.77 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.462293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2666  putative type IV pilus assembly protein PilP  46.39 
 
 		 183 aa  124  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000211304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1549  putative type IV pilus assembly protein PilP  48.94 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0995  putative type IV pilus assembly protein PilP  42.05 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1643  putative type IV pilus assembly protein PilP  37.79 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2135  pilus assembly protein, PilP-like  31.43 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761065  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0678  hypothetical protein  28.21 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.30381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0611  pilus assembly protein, PilQ  25.86 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0576908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0678  hypothetical protein  27.35 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0644  hypothetical protein  26.12 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2200  PilP  30.77 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1981  hypothetical protein  33.08 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0314098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0736  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP, putative  26.97 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0884  Pilus assembly protein PilP  26.97 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0689  hypothetical protein  23.73 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2208  putative fimbrial assembly protein PilP  23.84 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00448572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0330  hypothetical protein  40.74 
 
 		 326 aa  52  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2719  fimbrial assembly protein PilP  25.27 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2688  type 4 fimbrial biogenesis protein PilP  35.8 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000848303  normal  0.0164816 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0250  pilus assembly protein, PilQ  26.49 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.624121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5578  pilus assembly protein PilP  24.47 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694592 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1857  fimbrial assembly protein  24.46 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00682106  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02352  fimbrial assembly protein  26.05 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002325  type IV pilus biogenesis protein PilP  28.21 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.089507  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00030  fimbrial assembly protein PilP  26.83 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1880  type IV pilus assembly  24.28 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0999  pilus assembly protein, PilQ  26.7 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.435204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1786  pilus assembly protein PilP  25.18 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2170  pilus assembly protein, PilQ  24.28 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0954419  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2758  pilus assembly protein, PilQ  30.38 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.912715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3027  Pilus assembly protein PilP  27.97 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0668  pilus assembly protein, PilQ  23.43 
 
 		 177 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.56514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0829  pilus assembly protein, PilQ  29.52 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>