98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1678 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1678  methyltransferase type 11  100 
 
 
242 aa  509  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  34.86 
 
 
287 aa  52.8  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  32.65 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.61 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  24.68 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30 
 
 
285 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
255 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.21 
 
 
280 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.89 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.34 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30 
 
 
285 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0981  methyltransferase type 11  32.65 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
219 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
1476 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  22.64 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  41.54 
 
 
181 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
209 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.89 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  27.34 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  36 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  25 
 
 
235 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
225 aa  45.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  24.65 
 
 
279 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  30.3 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
186 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.69 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.11 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1252  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
270 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  30.69 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  22.84 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.38 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.43 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.33 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  23.64 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  26.57 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  29.91 
 
 
279 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  27.72 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0628  hypothetical protein  34.85 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.68 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.67 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2269  methyltransferase type 11  25.78 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.541668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  25.42 
 
 
293 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.68 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0807  methyltransferase type 11  26.87 
 
 
267 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3308  demethylmenaquinone methyltransferase  30.39 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.717606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  25 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.72 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.56 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
252 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.18 
 
 
207 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.6 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  26.05 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.6 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  40 
 
 
207 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0062  methyltransferase  29.11 
 
 
299 aa  42  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.48034  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  25.22 
 
 
236 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
273 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  40 
 
 
207 aa  42  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  29.85 
 
 
253 aa  42  0.008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 
207 aa  42  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30 
 
 
282 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  25.69 
 
 
291 aa  42  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  29.13 
 
 
259 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
268 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.08 
 
 
282 aa  42  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 
272 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  26.13 
 
 
282 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>