More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0314 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  73.58 
 
 		 496 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  73.83 
 
 		 496 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 		 493 aa  961    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.84 
 
 		 494 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  64.44 
 
 		 495 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.77 
 
 		 525 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.63 
 
 		 535 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.63 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  46.8 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  45.59 
 
 		 502 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.88 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  45.59 
 
 		 502 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  49.08 
 
 		 517 aa  411  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.38 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.71 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.37 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.06 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  44.09 
 
 		 502 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  44.35 
 
 		 501 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  43.57 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  41.65 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  44.06 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48 
 
 		 525 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  44.67 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  44.58 
 
 		 502 aa  393  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  41.88 
 
 		 510 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  45.07 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.01 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  44.49 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  44.27 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.68 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  44.87 
 
 		 503 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.63 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  43.86 
 
 		 505 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.91 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.31 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.86 
 
 		 585 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  43.33 
 
 		 509 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.88 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  43.33 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  43.32 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  43.62 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.06 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1295  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.58 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.29 
 
 		 514 aa  385  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  43.62 
 
 		 510 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  45.98 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  48.08 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  44.38 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.86 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.86 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  48.32 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.25 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.86 
 
 		 542 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  44.06 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  43.67 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  45.76 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  43.94 
 
 		 511 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  48.32 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3625  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.72 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.48 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  44.02 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.53 
 
 		 534 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.87 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  43.81 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.27 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.43 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.57 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 		 509 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.57 
 
 		 527 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  41.99 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  43.2 
 
 		 496 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  49.03 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  41.63 
 
 		 514 aa  372  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2049  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.09 
 
 		 495 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  42.6 
 
 		 511 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  43.81 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  44.22 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0252  NADH dehydrogenase subunit M  42.74 
 
 		 501 aa  371  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  41.99 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1367  NADH dehydrogenase subunit M  42.54 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73718  normal  0.0186615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  43.81 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  43.81 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  43.81 
 
 		 496 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  43.2 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  42.4 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  45.31 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  42.01 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>