More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4138 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.69 
 
 
552 aa  802    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.09 
 
 
548 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  75.79 
 
 
546 aa  850    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  68.99 
 
 
545 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.34 
 
 
548 aa  775    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  71.88 
 
 
546 aa  794    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.9 
 
 
547 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  66.18 
 
 
544 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.04 
 
 
544 aa  775    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  73.13 
 
 
543 aa  775    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.89 
 
 
547 aa  826    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
545 aa  1098    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.02 
 
 
549 aa  783    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.09 
 
 
548 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.84 
 
 
547 aa  813    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.46 
 
 
544 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.43 
 
 
550 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  65.75 
 
 
553 aa  737    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.33 
 
 
552 aa  779    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.95 
 
 
549 aa  792    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.44 
 
 
541 aa  768    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  72.81 
 
 
542 aa  779    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.02 
 
 
545 aa  762    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  75.74 
 
 
549 aa  856    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.66 
 
 
543 aa  788    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  65.19 
 
 
542 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.52 
 
 
555 aa  771    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  71.98 
 
 
543 aa  789    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.09 
 
 
548 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.96 
 
 
553 aa  785    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.1 
 
 
543 aa  729    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.83 
 
 
548 aa  800    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.84 
 
 
548 aa  817    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.87 
 
 
550 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.9 
 
 
545 aa  761    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.81 
 
 
548 aa  795    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  72.41 
 
 
549 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.12 
 
 
554 aa  825    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.66 
 
 
502 aa  619  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.1 
 
 
505 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.27 
 
 
509 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  60.55 
 
 
504 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.55 
 
 
504 aa  608  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  59.72 
 
 
507 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  59.92 
 
 
508 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
502 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.68 
 
 
509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.34 
 
 
503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  58.3 
 
 
501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.46 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.34 
 
 
503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.35 
 
 
510 aa  601  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  57.68 
 
 
502 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.48 
 
 
502 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.17 
 
 
502 aa  599  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  57.87 
 
 
509 aa  601  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
505 aa  599  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.51 
 
 
505 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 
509 aa  598  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.05 
 
 
502 aa  596  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.66 
 
 
501 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.74 
 
 
502 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.86 
 
 
505 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.78 
 
 
510 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.05 
 
 
510 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.58 
 
 
505 aa  592  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 
509 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.26 
 
 
505 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  57.87 
 
 
509 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  58.07 
 
 
501 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.48 
 
 
506 aa  592  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.2 
 
 
501 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.17 
 
 
510 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.17 
 
 
503 aa  589  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  58.35 
 
 
503 aa  589  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.26 
 
 
505 aa  591  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 
502 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.03 
 
 
502 aa  589  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.81 
 
 
502 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.09 
 
 
509 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  54.1 
 
 
512 aa  589  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.81 
 
 
502 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.37 
 
 
510 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.09 
 
 
509 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.23 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.89 
 
 
509 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.5 
 
 
502 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.3 
 
 
502 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.03 
 
 
502 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.94 
 
 
504 aa  588  1e-167  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.65 
 
 
526 aa  591  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 
510 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>