More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3710 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
346 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.51 
 
 
346 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  65.7 
 
 
346 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.14 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  62.79 
 
 
348 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  54.07 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  51.44 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 
347 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.45 
 
 
347 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 
347 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.4 
 
 
343 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.43 
 
 
349 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  49 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 
348 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 
341 aa  263  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.43 
 
 
347 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  45.05 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
350 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.68 
 
 
341 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.68 
 
 
341 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
347 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
347 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  38.86 
 
 
347 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.18 
 
 
341 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.18 
 
 
341 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.32 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  37.57 
 
 
353 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.47 
 
 
346 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.3 
 
 
347 aa  169  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.01 
 
 
342 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.82 
 
 
344 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
347 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.83 
 
 
349 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
356 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  34.19 
 
 
346 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  35.88 
 
 
344 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  33.97 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  35.9 
 
 
350 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.56 
 
 
336 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.03 
 
 
342 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  37.72 
 
 
357 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
350 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
342 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.4 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  33.98 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.38 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.38 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.98 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.71 
 
 
342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
342 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
344 aa  145  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 
340 aa  145  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
364 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  35.31 
 
 
344 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.52 
 
 
350 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 
364 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.52 
 
 
347 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.69 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
342 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
344 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
340 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  32.12 
 
 
336 aa  142  6e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.5 
 
 
350 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 
347 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  32.49 
 
 
341 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  33.81 
 
 
342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
337 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.52 
 
 
341 aa  139  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
342 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.05 
 
 
381 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.76 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.76 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.76 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.76 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.61 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.76 
 
 
357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.76 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.91 
 
 
368 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
338 aa  137  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
337 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
344 aa  136  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.03 
 
 
341 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.47 
 
 
343 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.08 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  34.86 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  34.76 
 
 
341 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  31.4 
 
 
341 aa  133  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.21 
 
 
347 aa  133  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
344 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  32.86 
 
 
342 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
345 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>