62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2887 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2887  methylenetetrahydrofolate reductase  100 
 
 		 310 aa  613  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11660  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  53.57 
 
 		 292 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1819  methylenetetrahydrofolate reductase  40.3 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4354  methylenetetrahydrofolate reductase  44.11 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.342919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19720  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  40.08 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0765  methylenetetrahydrofolate reductase  39.4 
 
 		 324 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1576  methylenetetrahydrofolate reductase  39 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00629171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0063  methylenetetrahydrofolate reductase  34.01 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1185  metF protein-like  29.71 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2769  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.29 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1411  putative 5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  31.29 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.959502 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2860  methylenetetrahydrofolate reductase  30.36 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1675  hypothetical protein  30.42 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.723201  normal  0.26163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1029  5 10-methylenetetrahydrofolate reductase-like protein  28.87 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2988  methylenetetrahydrofolate reductase  30.71 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6552  methylenetetrahydrofolate reductase  30.63 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2669  methylenetetrahydrofolate reductase  30.71 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0298352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03761  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  30.77 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1978  metfprotein-like  26.48 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.706266 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5726  methylenetetrahydrofolate reductase  29.6 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.799258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5841  methylenetetrahydrofolate reductase  27.01 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369115  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2038  methylenetetrahydrofolate reductase  30.17 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0703  methylenetetrahydrofolate reductase  25 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1498  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.58 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00302896  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1647  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.12 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.150812  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1279  methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  22.51 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0137  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.15 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.455806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1105  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  29.21 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0497695  normal  0.0196735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1089  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.83 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1552  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.78 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000427747  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1723  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.41 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05883  Methylenetetrahydrofolate reductase (EC 1.5.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B0P7]  29.29 
 
 		 627 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.89852  normal  0.953808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1822  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.36 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00652514  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71674  predicted protein  29.89 
 
 		 613 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.506465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05590  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.55 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0182  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.54 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344153  normal  0.0379106 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0832  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.47 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1108  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.32 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0091  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase oxidoreductase protein  24.21 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3083  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  28.44 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0275518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0396  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.72 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0468  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase (FADH)  24.38 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.301615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1758  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2651  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.86 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0977  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.1 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.310623  normal  0.108882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0530  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.11 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07390  methylenetetrahydrofolate reductase (NADPH), putative  24.59 
 
 		 633 aa  44.3  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.497264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1347  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.7 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00982491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5069  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.55 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0183  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.01 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.562647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3658  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.03 
 
 		 276 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0731  methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  25.9 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3335  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  24.03 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2125  Methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  24.19 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000980876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3844  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.19 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0318  methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H)  23.31 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000814714  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2367  Deleted entry  25.62 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0459  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  23.9 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0448  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  27.15 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1674  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  26.49 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.302516  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3110  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.15 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303787  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0537  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.45 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.854439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>