54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2458 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2458  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
135 aa  248  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4687  hypothetical protein  61.24 
 
 
138 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.938397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4599  hypothetical protein  61.24 
 
 
138 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4982  hypothetical protein  61.24 
 
 
138 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3947  protein of unknown function DUF1232  65.69 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0490  hypothetical protein  35.54 
 
 
249 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0751  hypothetical protein  33.06 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  25.74 
 
 
323 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1038  hypothetical protein  31.58 
 
 
171 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  25.53 
 
 
323 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1633  hypothetical protein  31.96 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.529644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3693  hypothetical protein  30.68 
 
 
211 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2259  hypothetical protein  23.96 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3740  uncharacterized small membrane protein  34.38 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0565  protein of unknown function DUF1232  26.67 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000140761  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3485  protein of unknown function DUF1232  32.35 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06411  hypothetical protein  44.23 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0576  hypothetical protein  44.23 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.64986  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06021  hypothetical protein  44.23 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06321  hypothetical protein  44.23 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  44.23 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  40.58 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0864  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  48.72 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0974  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  40.58 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0721  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000923081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4472  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.200573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0905  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6700199999999999e-43 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  44.23 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0809  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0707  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000547065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0720  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0244927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0772  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000133286  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0901  hypothetical protein  31.82 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  37.25 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  54.05 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05801  hypothetical protein  41.3 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  33.78 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  40.38 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1439  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  41.33 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  36.23 
 
 
116 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  34.94 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2241  hypothetical protein  52.94 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0559618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  47.5 
 
 
100 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  30.3 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  36.73 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  39.13 
 
 
121 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  50 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  55.17 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  45 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2863  hypothetical protein  55.88 
 
 
114 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0874191  normal  0.0688693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5369  hypothetical protein  43.86 
 
 
162 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>