More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2257 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2257  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 480 aa  939    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0515  sodium:dicarboxylate symporter  70.24 
 
 		 456 aa  628  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.505334  normal  0.112871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2035  sodium:dicarboxylate symporter  67.11 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4398  sodium:dicarboxylate symporter  71.05 
 
 		 458 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.371032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3595  sodium:dicarboxylate symporter  69.87 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4176  sodium:dicarboxylate symporter  71.05 
 
 		 458 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4242  sodium:dicarboxylate symporter  71.05 
 
 		 458 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  normal  0.0919458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4696  sodium:dicarboxylate symporter  69.65 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25740  Na+/H+ dicarboxylate symporter  69.27 
 
 		 456 aa  594  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3870  sodium:dicarboxylate symporter  71.53 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137849  normal  0.102807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1323  sodium:dicarboxylate symporter  70.93 
 
 		 464 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1530  sodium:dicarboxylate symporter  64.83 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000123662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1530  sodium:dicarboxylate symporter  63.53 
 
 		 447 aa  543  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222231  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12470  C4-dicarboxylate-transport transmembrane protein dctA  64.51 
 
 		 491 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000112965  normal  0.468054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14090  Na+/H+ dicarboxylate symporter  60.22 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1151  sodium:dicarboxylate symporter  61.68 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0356  sodium:dicarboxylate symporter  51.14 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.212213  normal  0.69556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3546  sodium:dicarboxylate symporter  45.43 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1200  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.82 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4228  C4-dicarboxylate transporter DctA  48.28 
 
 		 440 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1188  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.59 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1774  sodium:dicarboxylate symporter  49.55 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458594  normal  0.0497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1218  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.82 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0381  sodium:dicarboxylate symporter  45.83 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000240059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4772  sodium:dicarboxylate symporter  48.63 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  normal  0.37681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0367  sodium:dicarboxylate symporter  48.5 
 
 		 447 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3225  sodium:dicarboxylate symporter  45.75 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3258  sodium:dicarboxylate symporter  48.39 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.823996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5694  sodium:dicarboxylate symporter  45.56 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3748  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.96 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1682  C4-dicarboxylate transport protein  46 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.662063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4236  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.86 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1039  sodium:dicarboxylate symporter  45.52 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.681651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4196  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.49 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49130  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.49 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3501  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.8 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2994  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.17 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.134288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3283  sodium:dicarboxylate symporter  49.17 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4178  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.24 
 
 		 454 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5339  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.79 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3707  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.42 
 
 		 450 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151684 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0185  sodium:dicarboxylate symporter  46.62 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4016  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.62 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3934  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.62 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3836  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.62 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.275466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3731  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.62 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0189  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.62 
 
 		 428 aa  362  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0982  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.91 
 
 		 452 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206436  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03376  C4-dicarboxylate transport protein  46.62 
 
 		 428 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03329  hypothetical protein  46.62 
 
 		 428 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4892  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.38 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.321398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1437  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.93 
 
 		 447 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0432682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3059  sodium:dicarboxylate symporter  49.28 
 
 		 447 aa  360  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3925  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.26 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1456  sodium:dicarboxylate symporter  48.1 
 
 		 446 aa  358  8e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0027  sodium:dicarboxylate symporter  46.73 
 
 		 450 aa  358  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0132  sodium:dicarboxylate symporter  48.46 
 
 		 449 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0735159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0009  sodium:dicarboxylate symporter  46.5 
 
 		 450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2034  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.89 
 
 		 442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3809  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.1 
 
 		 428 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.708508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3990  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.1 
 
 		 428 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.142242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3886  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.1 
 
 		 428 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3822  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.1 
 
 		 428 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3930  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.1 
 
 		 428 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.080438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4064  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.36 
 
 		 429 aa  356  5.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4067  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.36 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.409819 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0098  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.36 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2234  sodium:dicarboxylate symporter  46.17 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.709095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3010  Sodium:dicarboxylate symporter  46.29 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0666603  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1840  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.84 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.731313  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2884  sodium:dicarboxylate symporter  46.93 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701489  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6225  C4-dicarboxylate transport protein  46.6 
 
 		 444 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0080  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.8 
 
 		 430 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2978  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.03 
 
 		 444 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231883  normal  0.172231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4078  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.43 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2726  sodium:dicarboxylate symporter  45.7 
 
 		 445 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.878758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0083  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.8 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4205  C4-dicarboxylate transport protein  44.72 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2032  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.6 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2717  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.95 
 
 		 443 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2859  sodium:dicarboxylate symporter  45.21 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2441  sodium:dicarboxylate symporter  46.03 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.990408  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33260  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.81 
 
 		 442 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3480  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.32 
 
 		 444 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0192  C4-dicarboxylate transporter DctA  47.04 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0620705 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3890  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.98 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0186  C4-dicarboxylate transporter DctA  46.81 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436113  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0153  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.94 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0330  C4-dicarboxylate transporter DctA  45.93 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3353  sodium:dicarboxylate symporter  47 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1855  sodium:dicarboxylate symporter  44.53 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2241  sodium:dicarboxylate symporter  44.68 
 
 		 443 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2324  sodium:dicarboxylate symporter  43.47 
 
 		 465 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365188  normal  0.479162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3597  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.25 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021811 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3346  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.25 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00211585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3294  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.25 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0209332  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4765  sodium:dicarboxylate symporter  46.81 
 
 		 455 aa  340  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3697  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.01 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0331766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1620  C4-dicarboxylate transporter DctA  44.01 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000559641  hitchhiker  0.000636022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2244  C4-dicarboxylate transporter DctA  43.35 
 
 		 413 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0602805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>