43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1155 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1155  hypothetical protein  100 
 
 		 689 aa  1392    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2011  hypothetical protein  38.41 
 
 		 684 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1159  hypothetical protein  40.26 
 
 		 392 aa  260  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.45694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.22 
 
 		 1424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2861  hypothetical protein  30.74 
 
 		 504 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0476882  normal  0.0347919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1090  hypothetical protein  34.69 
 
 		 268 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  31.89 
 
 		 302 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  29.43 
 
 		 293 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  28.61 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3408  heat repeat-containing PBS lyase  30.4 
 
 		 1203 aa  94.7  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.539879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1238 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  24.4 
 
 		 699 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3909  hypothetical protein  28.77 
 
 		 697 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  29.07 
 
 		 689 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3407  FHA domain containing protein  25.56 
 
 		 562 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2709  FHA domain containing protein  25.56 
 
 		 562 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  26.86 
 
 		 1429 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.85 
 
 		 943 aa  58.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  34.03 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1986  hypothetical protein  25.68 
 
 		 682 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  23.34 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  23.97 
 
 		 496 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1285 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30.72 
 
 		 1611 aa  55.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1020 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1689 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1526 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5268  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1958 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.494598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  24.42 
 
 		 514 aa  51.6  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  28.07 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  28.26 
 
 		 442 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  25 
 
 		 559 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1298 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  22.99 
 
 		 500 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1063 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  24.8 
 
 		 481 aa  48.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  26.49 
 
 		 440 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0929  hypothetical protein  19.21 
 
 		 409 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.230723  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  24.67 
 
 		 358 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6006  hypothetical protein  27.93 
 
 		 610 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0687  hypothetical protein  22.45 
 
 		 519 aa  44.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0836  hypothetical protein  22.45 
 
 		 613 aa  44.3  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.715517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  34.82 
 
 		 1736 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0314468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>