More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2101 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2101  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 382 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  50.56 
 
 		 824 aa  344  1e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  47.42 
 
 		 810 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  46.5 
 
 		 809 aa  301  1e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  46.43 
 
 		 809 aa  300  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  44.04 
 
 		 364 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  44.64 
 
 		 812 aa  288  1e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  47.76 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  46.76 
 
 		 798 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  43.53 
 
 		 754 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1816  phosphoenolpyruvate synthase  45.09 
 
 		 797 aa  272  7e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  45.23 
 
 		 779 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2833  phosphoenolpyruvate synthase  45.24 
 
 		 798 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2399  phosphoenolpyruvate synthase  43.84 
 
 		 799 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.628825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1382  phosphoenolpyruvate synthase  43.84 
 
 		 796 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  44.71 
 
 		 805 aa  266  4e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  41.42 
 
 		 769 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  44.07 
 
 		 794 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2050  phosphoenolpyruvate synthase  44.19 
 
 		 801 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.112575  normal  0.511905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  41.64 
 
 		 758 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3042  phosphoenolpyruvate synthase  42.74 
 
 		 799 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  42.65 
 
 		 795 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  45.43 
 
 		 795 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  43.24 
 
 		 800 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1521  phosphoenolpyruvate synthase  44.14 
 
 		 784 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  41.03 
 
 		 758 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2191  phosphoenolpyruvate synthase  43.6 
 
 		 799 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.750025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  42.93 
 
 		 803 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  42.94 
 
 		 790 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  44.61 
 
 		 805 aa  260  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  43.16 
 
 		 781 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5064  phosphoenolpyruvate synthase  42.82 
 
 		 796 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  44.87 
 
 		 795 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  45.43 
 
 		 795 aa  259  8e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  40.43 
 
 		 758 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  45.13 
 
 		 794 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  43.57 
 
 		 791 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 		 796 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1864  phosphoenolpyruvate synthase  46.43 
 
 		 794 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0751909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  43.97 
 
 		 796 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  45.86 
 
 		 801 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  43.36 
 
 		 789 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 789 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1904  phosphoenolpyruvate synthase  45.29 
 
 		 799 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.809978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5312  phosphoenolpyruvate synthase  45.13 
 
 		 800 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0521327  normal  0.180473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  45.73 
 
 		 792 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2035  phosphoenolpyruvate synthase  45.29 
 
 		 799 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.733283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  43.53 
 
 		 789 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  43.82 
 
 		 789 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  43.82 
 
 		 789 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  44.84 
 
 		 790 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  44.82 
 
 		 790 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  43.82 
 
 		 789 aa  253  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  43.53 
 
 		 789 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 		 839 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 		 839 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2415  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 		 812 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0611735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  45.29 
 
 		 791 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 792 aa  252  6e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 		 789 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  41.19 
 
 		 782 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 		 789 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2488  phosphoenolpyruvate synthase  42.35 
 
 		 789 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172291  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  40.91 
 
 		 758 aa  252  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  43.8 
 
 		 805 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  42.65 
 
 		 789 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  40.62 
 
 		 761 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  42.15 
 
 		 792 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  42.65 
 
 		 791 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1321  phosphoenolpyruvate synthase  44.25 
 
 		 801 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  43.24 
 
 		 789 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  42.78 
 
 		 815 aa  251  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 		 761 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1274  phosphoenolpyruvate synthase  44.71 
 
 		 799 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  42.44 
 
 		 792 aa  250  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 810 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  44.51 
 
 		 791 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  43.66 
 
 		 787 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6075  phosphoenolpyruvate synthase  44.41 
 
 		 800 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2022  phosphoenolpyruvate synthase  44.41 
 
 		 800 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.233402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  42.73 
 
 		 808 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2002  phosphoenolpyruvate synthase  44.41 
 
 		 800 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  42.82 
 
 		 790 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1306  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1535  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.116027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2561  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.424098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2715  phosphoenolpyruvate synthase  44.41 
 
 		 789 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000237182  hitchhiker  0.00109533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2470  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3277  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.818512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2035  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 		 799 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  42.15 
 
 		 792 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  42.73 
 
 		 792 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2062  phosphoenolpyruvate synthase  42.77 
 
 		 796 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.224612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>