26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0735 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0735  N-terminal methylation  100 
 
 		 345 aa  705    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.728244  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1064  hypothetical protein  37.19 
 
 		 308 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  22.56 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  29.85 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  33.72 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  32.39 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  31.82 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  30.59 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  23.08 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  24.42 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  34.44 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  22.5 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  34.38 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  25.13 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  23.23 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  35.48 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  35.48 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  33.78 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  29.51 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  23.08 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3429  hypothetical protein  18.73 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  28.17 
 
 		 214 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  34.48 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  34.29 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  33.87 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1728  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.148636  normal  0.0609211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>