More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2127 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  100 
 
 
296 aa  597  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  60.14 
 
 
296 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  60.4 
 
 
297 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  60.74 
 
 
298 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  59.4 
 
 
297 aa  353  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  58.39 
 
 
299 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  325  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  325  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  325  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  52.86 
 
 
301 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  51.52 
 
 
301 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  51.85 
 
 
301 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 
301 aa  318  7e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  51.68 
 
 
302 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  51.01 
 
 
302 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  50.67 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  48.98 
 
 
298 aa  295  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  47.14 
 
 
300 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
299 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
299 aa  291  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4275  GTP-binding protein Era  50 
 
 
303 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  49.48 
 
 
303 aa  290  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  50 
 
 
299 aa  286  2e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  46.31 
 
 
303 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  48.46 
 
 
303 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 
303 aa  287  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2479  GTP-binding protein Era  46.23 
 
 
302 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.080148  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  49.49 
 
 
299 aa  286  4e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  44.9 
 
 
298 aa  282  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0646  GTP-binding protein Era  46.8 
 
 
305 aa  281  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.601606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  47.83 
 
 
303 aa  280  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
294 aa  276  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0989  GTPase  49.66 
 
 
305 aa  276  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00032345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  47.33 
 
 
303 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  44.37 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1067  GTP-binding protein Era  47.64 
 
 
297 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
296 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  46.62 
 
 
307 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  48.45 
 
 
293 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  45.61 
 
 
306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  47.62 
 
 
324 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2156  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0600  GTP-binding protein Era  47.28 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  47.1 
 
 
308 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  47.32 
 
 
307 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2293  GTP-binding protein Era  46.38 
 
 
310 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0382696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  46.46 
 
 
300 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2205  GTP-binding protein Era  46.05 
 
 
310 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395814  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
311 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
310 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0671  GTP-binding protein Era  46.92 
 
 
301 aa  263  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.584741  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  47.47 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
302 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 
305 aa  259  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  43.39 
 
 
311 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  44.75 
 
 
334 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
314 aa  258  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  45.92 
 
 
301 aa  256  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 
300 aa  256  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  46.26 
 
 
300 aa  255  6e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
302 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  43.58 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  43.96 
 
 
312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  43.77 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  45.39 
 
 
299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
334 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
299 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  44.71 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
339 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
299 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
299 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
299 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
299 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
311 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  43.69 
 
 
299 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0808  GTP-binding protein Era  45.05 
 
 
299 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
339 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
339 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  44.11 
 
 
339 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  44.52 
 
 
294 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  44.59 
 
 
300 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  43.34 
 
 
299 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 
307 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  44.03 
 
 
299 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
338 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  41.75 
 
 
301 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
338 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
338 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  43.43 
 
 
338 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  45.83 
 
 
287 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  41.41 
 
 
301 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>