More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1010 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  100 
 
 
338 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  75.44 
 
 
338 aa  497  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  69.82 
 
 
338 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  69.82 
 
 
338 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  69.82 
 
 
338 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  68.34 
 
 
338 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  68.34 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.99 
 
 
426 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  58.41 
 
 
387 aa  352  5e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.23 
 
 
417 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  59.09 
 
 
356 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.03 
 
 
354 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.03 
 
 
354 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  54.73 
 
 
354 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  52.24 
 
 
346 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  54.93 
 
 
353 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  52.84 
 
 
423 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  54.63 
 
 
432 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.87 
 
 
425 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  56.16 
 
 
347 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  52.68 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  53.43 
 
 
428 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.72 
 
 
464 aa  328  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  56.36 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.47 
 
 
434 aa  324  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  51.94 
 
 
428 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.44 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  53.75 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  52.24 
 
 
428 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.42 
 
 
463 aa  318  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  51.06 
 
 
430 aa  318  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  51.06 
 
 
430 aa  318  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  51.81 
 
 
370 aa  318  7e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  52.24 
 
 
428 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  52.24 
 
 
428 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  51.94 
 
 
428 aa  318  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  51.94 
 
 
428 aa  318  9e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  51.94 
 
 
428 aa  318  9e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  51.94 
 
 
428 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.98 
 
 
348 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  51.94 
 
 
427 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  51.94 
 
 
428 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  52.57 
 
 
365 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  53.29 
 
 
419 aa  315  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  51.64 
 
 
428 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  54.65 
 
 
406 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  52.74 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.36 
 
 
365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.15 
 
 
340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  54.35 
 
 
406 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.61 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  51.36 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  52.94 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  52.98 
 
 
397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.6 
 
 
425 aa  312  3.9999999999999997e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  52.52 
 
 
349 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.35 
 
 
356 aa  311  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  50.76 
 
 
341 aa  310  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  52.21 
 
 
366 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 
369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.25 
 
 
333 aa  309  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  54.63 
 
 
423 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.6 
 
 
458 aa  309  5e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  51.85 
 
 
408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  51.85 
 
 
408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  49.39 
 
 
430 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  51.8 
 
 
358 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  52.11 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  51.95 
 
 
370 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  51.66 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  50.15 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  51.54 
 
 
408 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  49.57 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  52.85 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  52.4 
 
 
353 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  50.15 
 
 
395 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.1 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  50.75 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  52.11 
 
 
407 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  52.4 
 
 
353 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50.46 
 
 
435 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  52.74 
 
 
334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50.46 
 
 
435 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  52.25 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.04 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  50.45 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.85 
 
 
326 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  51.47 
 
 
370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  51.64 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  52.1 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.19 
 
 
334 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.95 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  301  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.5 
 
 
372 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.25 
 
 
358 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>