More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2959 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2959  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 125 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585888  normal  0.16288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5082  50S ribosomal protein L7/L12  84 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487843  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  82.26 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1530  50S ribosomal protein L7/L12  83.2 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3688  50S ribosomal protein L7/L12  81.6 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1349  50S ribosomal protein L7/L12  80.8 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.262867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3363  50S ribosomal protein L7/L12  82.4 
 
 		 124 aa  153  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.304303  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3196  50S ribosomal protein L7/L12  79.2 
 
 		 123 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.380121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3459  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 123 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.886591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2222  50S ribosomal protein L7/L12  70.4 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0361  50S ribosomal protein L7/L12  80.95 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1820  50S ribosomal protein L7/L12  79.2 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0400665  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2284  50S ribosomal protein L7/L12  77.6 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4498  50S ribosomal protein L7/L12  80.16 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1899  50S ribosomal protein L7/L12  81.75 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3840  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00160785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  78.57 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4016  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.797485  normal  0.61149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1946  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0743276  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4385  50S ribosomal protein L7/L12  80 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2696  50S ribosomal protein L7/L12  76.8 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10114  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1206  50S ribosomal protein L7/L12  79.2 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.431527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2728  ribosomal protein L7/L12  77.6 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0977  50S ribosomal protein L7/L12  75.2 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1245  50S ribosomal protein L7/L12  78.4 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  77.78 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3476  50S ribosomal protein L7/L12  74.6 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145567  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1323  50S ribosomal protein L7/L12  75.2 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.160578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  71.2 
 
 		 124 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1421  50S ribosomal protein L7/L12  76 
 
 		 125 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927716  normal  0.299454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  65.89 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2360  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2272  50S ribosomal protein L7/L12  69.6 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  65.83 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  72.8 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0570  50S ribosomal protein L7/L12  68 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000202265  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1823  50S ribosomal protein L7/L12  73.6 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2680  50S ribosomal protein L7/L12  66.39 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00234382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0356  50S ribosomal protein L7/L12  63.93 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0227516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0790  50S ribosomal protein L7/L12  70.63 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.188773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  67.23 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  67.23 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4677  50S ribosomal protein L7/L12  63.78 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0969346  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1963  50S ribosomal protein L7/L12  68.07 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.128486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1803  50S ribosomal protein L12P  68 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.116648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  62.79 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0232  50S ribosomal protein L7/L12  65 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0946443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  57.5 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  68.8 
 
 		 123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0567  50S ribosomal protein L7/L12  60.48 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  63.48 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 		 127 aa  117  7e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  55 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0693  ribosomal protein L7/L12  66.14 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904512  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0287  50S ribosomal protein L7/L12  59.52 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000028458  normal  0.010711 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  62.5 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0266  50S ribosomal protein L7/L12  60.32 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0233  ribosomal protein L7/L12  69.17 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.643135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3170  50S ribosomal protein L7/L12  52.8 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0397  50S ribosomal protein L7/L12  64.17 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.294224  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  63.48 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1107  ribosomal protein L7/L12  57.94 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0747227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0746  50S ribosomal protein L7/L12  59.2 
 
 		 124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00478946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  54.47 
 
 		 129 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0758  50S ribosomal protein L7/L12  63.87 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.599811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  64.84 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4017  ribosomal protein L7/L12  58.59 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.712821  normal  0.474419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  59.66 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  64.35 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0923  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000276114  hitchhiker  0.0000101769 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  60.5 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  47.5 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0318  50S ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132009  hitchhiker  0.00085028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2809  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000299683  normal  0.290865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0618  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1709  50S ribosomal protein L7/L12  49.6 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.197098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2543  50S ribosomal protein L7/L12  58.4 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  51.67 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2864  50S ribosomal protein L7/L12  62.99 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.310416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  60.48 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  64.52 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0352  50S ribosomal protein L7/L12  56.52 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0074009  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2332  50S ribosomal protein L7/L12  61.34 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.140458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1548  ribosomal protein L7/L12  61.79 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0839  50S ribosomal protein L12P  63.87 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12937  normal  0.0961765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0206  50S ribosomal protein L7/L12  64 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  65.6 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0338  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0390  ribosomal protein L7/L12  57.03 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3861  50S ribosomal protein L7/L12  56.69 
 
 		 122 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000856877  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20970  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0672  50S ribosomal protein L7/L12  61.42 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  50.83 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1700  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0352  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0338  50S ribosomal protein L7/L12  61.11 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.826751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  58.73 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>