29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2339 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2339  putative methylamine utilization protein MauE  100 
 
 
179 aa  328  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0549  methylamine utilisation MauE  41.8 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.340856  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0564  methylamine utilisation MauE  39.67 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5633  DoxX family protein  39 
 
 
228 aa  62  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0914  DoxX  36.17 
 
 
188 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.491535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4471  hypothetical protein  40.37 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3306  hypothetical protein  39.45 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5061  hypothetical protein  39.45 
 
 
184 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1657  DoxX family protein  30.66 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.223819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0602  hypothetical protein  40.37 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1352  DoxX family protein  39.6 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0506  methylamine utilization protein MauE, putative  32.26 
 
 
138 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4996  hypothetical protein  40.37 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.351525  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3388  DoxX family protein  27.68 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0577115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3019  methylamine utilization protein MauE, putative  32.48 
 
 
138 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000103678  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0979  DoxX family protein  31.13 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2945  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2223  methylamine utilisation MauE  40.52 
 
 
178 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0575  DoxX family protein  33.65 
 
 
145 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405751  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4731  methylamine utilisation MauE  37.93 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0586854  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5223  hypothetical protein  39.58 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2942  hypothetical protein  36.45 
 
 
192 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3819  hypothetical protein  35.42 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.931026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1352  DoxX family protein  38.46 
 
 
154 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3921  DoxX family protein  32.48 
 
 
146 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0588  DoxX family protein  32.26 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3253  hypothetical protein  47.06 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000796104  hitchhiker  0.00083693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1453  DoxX family protein  33.03 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2522  methylamine utilization protein MauE, putative  32.2 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000286743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>