46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1451 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1451  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 560 aa  1139    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.757394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  30.91 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  27.62 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  25.46 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  24.64 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  23.05 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  28.07 
 
 		 499 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  25.21 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  25 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  23.54 
 
 		 559 aa  66.6  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  24.21 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  28.43 
 
 		 364 aa  63.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  22.41 
 
 		 610 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  23.57 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  31.29 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  31.29 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  25.95 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  22.76 
 
 		 442 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  23.68 
 
 		 575 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  21.46 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  21.78 
 
 		 431 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  21.46 
 
 		 426 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  22.41 
 
 		 446 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  30 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  26.79 
 
 		 390 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  23.45 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  21.78 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  21.31 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  21.04 
 
 		 431 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  24.3 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  27.38 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0900  hypothetical protein  23.06 
 
 		 539 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  24.48 
 
 		 415 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  20.79 
 
 		 426 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  24.15 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  23.1 
 
 		 404 aa  47  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  23.2 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  23.3 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  23.02 
 
 		 438 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  24.03 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  23.02 
 
 		 438 aa  44.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  21.53 
 
 		 414 aa  43.9  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>