49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3531 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3531  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  812    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2958  hypothetical protein  25 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0760444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3002  hypothetical protein  24.68 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3248  hypothetical protein  24.43 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3017  hypothetical protein  27.72 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0773038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2939  hypothetical protein  24.68 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3856  hypothetical protein  24.57 
 
 		 458 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4379  protein of unknown function DUF201  23.91 
 
 		 323 aa  99.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002731  carbamoylphosphate synthase large subunit  24.91 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2975  hypothetical protein  22.7 
 
 		 454 aa  93.6  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4983  hypothetical protein  23.06 
 
 		 452 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.301738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  26.79 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  26.15 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0668  ATP-grasp protein-like protein  26.69 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4600  ATP-grasp protein-like protein  25.32 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.215683  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0081  hypothetical protein  25.54 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  24.55 
 
 		 513 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0146  hypothetical protein  25.86 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2016  ATP-grasp protein-like protein  25.09 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.943806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2200  ATP-grasp protein-like protein  25.33 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0637  hypothetical protein  28.64 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.110504  normal  0.0645726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0665  protein of unknown function DUF201  24.57 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3050  hypothetical protein  25 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3434  ATP-grasp protein-like protein  22.45 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06402  conserved hypothetical protein  24.82 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0546217 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3047  hypothetical protein  23.84 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836021  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4899  hypothetical protein  25.46 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1350  ATP-grasp protein-like protein  23.59 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1598  ATP-grasp enzyme-like protein  21.74 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.116073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2618  carbamoylphosphate synthase large subunit (split gene in MJ)-like  20.51 
 
 		 387 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  26.16 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  21.79 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.29 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  27.01 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5706  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, ATPase subunit  25.95 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  27.01 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3202  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  28.5 
 
 		 1079 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1308  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  25.49 
 
 		 1082 aa  46.6  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0519  pyruvate carboxylase  22.22 
 
 		 1144 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1477  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  26.29 
 
 		 1054 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.438417  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1087  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.6 
 
 		 1062 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  26.5 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.51 
 
 		 1065 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0045  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  23.6 
 
 		 604 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.308823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1498  carbamoyl phosphate synthase large subunit  26.04 
 
 		 1064 aa  43.9  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.75 
 
 		 405 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50410  Multifunctional pyrimidine synthesis protein CAD (includes carbamoyl-phophate synthetase, aspartate transcarbamylase, and glutamine amidotransferase)  26.8 
 
 		 1148 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.280294  normal  0.615916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  25.7 
 
 		 359 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1349  ATP-grasp protein-like protein  21.9 
 
 		 525 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.971756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>