More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1909 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 364 aa  731    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  75.35 
 
 		 357 aa  547  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  76.06 
 
 		 357 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  76.06 
 
 		 357 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  76.06 
 
 		 357 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  77.93 
 
 		 362 aa  542  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  75.42 
 
 		 357 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  76.16 
 
 		 357 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  68.3 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  64.87 
 
 		 361 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  64.67 
 
 		 355 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  66.28 
 
 		 358 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  63.43 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  62.11 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  64.86 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  63.4 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  65 
 
 		 364 aa  421  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  61.36 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  61.1 
 
 		 361 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  62.15 
 
 		 363 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 357 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  62.64 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  62.15 
 
 		 373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  61.31 
 
 		 357 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  59.49 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  64.26 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  65.17 
 
 		 362 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  61.11 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  63.91 
 
 		 361 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 		 369 aa  375  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  60.57 
 
 		 357 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  61.43 
 
 		 355 aa  361  9e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  63.45 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  50.72 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  50.58 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  55.23 
 
 		 378 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  48.87 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.57 
 
 		 356 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  53.58 
 
 		 360 aa  322  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  51.01 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  46.51 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  52.96 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0836  peptide chain release factor 1  46.06 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 360 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 356 aa  318  9e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  45.51 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  51.44 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  48.2 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  48.32 
 
 		 360 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  46.26 
 
 		 358 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  45.98 
 
 		 358 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.09 
 
 		 357 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  52.34 
 
 		 360 aa  315  8e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  51.42 
 
 		 360 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 357 aa  315  9e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  47.91 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  47.91 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  47.91 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  47.91 
 
 		 360 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  46.61 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  45.35 
 
 		 361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  45.69 
 
 		 358 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  48.41 
 
 		 358 aa  311  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2714  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 355 aa  311  9e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.64557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  46.82 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  47.18 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  45.4 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  50.62 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  45.76 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000477535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  47.49 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0292  peptide chain release factor 1  47.95 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.694941  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08900  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 357 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000087001  normal  0.899711 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  48.24 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  46.05 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  47.46 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>