66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1741 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  954    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  62.1 
 
 		 618 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  41.75 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  34.55 
 
 		 567 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.14 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  36.29 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  36.29 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  31.45 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  28.46 
 
 		 550 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  31.13 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  31.13 
 
 		 508 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  30.35 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  30.35 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  37.43 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  30.45 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  38.07 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  29.96 
 
 		 514 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  28.8 
 
 		 586 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  37.16 
 
 		 517 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  34.93 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  35.29 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  35.29 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  34 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  27.49 
 
 		 593 aa  80.1  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  31.05 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  29.59 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  28.4 
 
 		 601 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  30.86 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  29.18 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  29.18 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  31.36 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  31.36 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1175  phage tail tape measure protein, TP901 family  68.09 
 
 		 1343 aa  73.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  30.53 
 
 		 601 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  28.85 
 
 		 506 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  26.09 
 
 		 546 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  29.18 
 
 		 578 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  29.18 
 
 		 578 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  30.91 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  30.74 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  30.91 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  33.02 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  33.02 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  31.08 
 
 		 620 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  33.02 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1179  hypothetical protein  61.11 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  32.46 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  26.1 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  30.94 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  26.53 
 
 		 567 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1759  HNH nuclease  27.69 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  28.04 
 
 		 550 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 516 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.83 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  26.56 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3247  HNH nuclease  25.1 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  27.07 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  25.7 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  29.38 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  25.81 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  28.5 
 
 		 519 aa  47  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  24.63 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3187  HNH nuclease  26.82 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.83649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  26.56 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  28.25 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.1 
 
 		 2179 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>