35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0260 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0260  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  793    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  42.45 
 
 		 393 aa  305  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3787  hypothetical protein  38.5 
 
 		 392 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.036851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2282  hypothetical protein  37.3 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  38.48 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3143  hypothetical protein  35.66 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60988  normal  0.0276228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3892  hypothetical protein  37.72 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.361535  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  24.75 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  29.32 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.25 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  29.33 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  22.76 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  23.24 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  24.74 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  24.12 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.88 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.8 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  22.6 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 		 328 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.12 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.54 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  21.96 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  22.27 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  22.08 
 
 		 373 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  22.43 
 
 		 374 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  22.03 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.6 
 
 		 343 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  21.49 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  22.48 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  20.63 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.29 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 915 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>