More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3422 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3422  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3483  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  98.94 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000994394 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3755  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  78.72 
 
 
283 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.044256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2863  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  74.82 
 
 
295 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00148753  hitchhiker  0.000000691247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0651  carbon-nitrogen family hydrolase  75.8 
 
 
283 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2229  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  66.9 
 
 
282 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0031262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2119  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  42.65 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1699  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  40.07 
 
 
286 aa  222  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1066  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  39.34 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1883  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  40 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1495  carbon-nitrogen hydrolase family protein  37.82 
 
 
285 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0846  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  37.5 
 
 
287 aa  208  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.167349  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1075  carbon-nitrogen hydrolase family protein  37.82 
 
 
280 aa  206  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1590  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.11 
 
 
291 aa  201  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00676136  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08660  predicted amidohydrolase  38.99 
 
 
280 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.68483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0276  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36.49 
 
 
300 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1112  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.89 
 
 
316 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4289  NAD+ synthetase  36.9 
 
 
622 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1445  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  36 
 
 
279 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4889  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 
306 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  34.78 
 
 
575 aa  136  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2248  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.59 
 
 
282 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001533  glutamine amidotransferase chain of NAD synthetase  31.18 
 
 
278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.999014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  31.45 
 
 
576 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  31.45 
 
 
576 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  33.88 
 
 
577 aa  125  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2902  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.82 
 
 
270 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  30.6 
 
 
573 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  31.73 
 
 
583 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2359  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  32.34 
 
 
566 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  32.4 
 
 
545 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  34.36 
 
 
587 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.76 
 
 
566 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  30.77 
 
 
574 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0707  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
295 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0697  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.23 
 
 
255 aa  117  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  31.44 
 
 
566 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0501  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
279 aa  115  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.841658  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  32.84 
 
 
569 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  31.2 
 
 
569 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  32.8 
 
 
561 aa  112  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2857  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.68 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.190038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  33.06 
 
 
552 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1510  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  31.69 
 
 
299 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  33.73 
 
 
577 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  33.09 
 
 
556 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  34.16 
 
 
543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2352  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.83 
 
 
286 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  31.33 
 
 
540 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  28.24 
 
 
552 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  30.19 
 
 
570 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1941  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.24 
 
 
303 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.516758 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  29.07 
 
 
558 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  32.53 
 
 
567 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  32.53 
 
 
567 aa  106  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2118  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.46 
 
 
285 aa  105  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.556726  normal  0.0624833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  30.88 
 
 
567 aa  105  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2741  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.97 
 
 
294 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  29.28 
 
 
566 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  30.97 
 
 
567 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  31.97 
 
 
548 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.5 
 
 
556 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  32.78 
 
 
554 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1822  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  27.64 
 
 
294 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  30.5 
 
 
565 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  30.42 
 
 
553 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  30.38 
 
 
601 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1717  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.62 
 
 
291 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  30.28 
 
 
543 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  29.96 
 
 
565 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  31.44 
 
 
556 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  29.89 
 
 
552 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0784  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  28.32 
 
 
295 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  29.89 
 
 
565 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  32.3 
 
 
553 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  30.68 
 
 
591 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1602  pantothenase  29.31 
 
 
295 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  30.77 
 
 
584 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1545  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.31 
 
 
295 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.838608  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  31.95 
 
 
599 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  29.63 
 
 
542 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.63 
 
 
542 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  32.44 
 
 
571 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  33.87 
 
 
539 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  33.94 
 
 
554 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2038  NAD+ synthetase  35.14 
 
 
564 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.98 
 
 
577 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  31.44 
 
 
606 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2278  NAD synthetase  32.93 
 
 
553 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  27 
 
 
557 aa  99.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1862  carbon-nitrogen family hydrolase  28.87 
 
 
295 aa  99  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00415258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  29.23 
 
 
565 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1377  NAD synthetase  33.33 
 
 
569 aa  98.2  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  32.1 
 
 
547 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  27.82 
 
 
540 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1141  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  29.39 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  27.34 
 
 
560 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1641  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  30.45 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  32.57 
 
 
559 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>