More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2018 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  86.04 
 
 
222 aa  384  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  65.07 
 
 
250 aa  286  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  63.13 
 
 
251 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  62.38 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  63.64 
 
 
255 aa  279  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  59.63 
 
 
252 aa  278  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
256 aa  277  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  63.64 
 
 
247 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  63.16 
 
 
247 aa  275  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  62.68 
 
 
257 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  64.95 
 
 
256 aa  272  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  63.33 
 
 
252 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  67.29 
 
 
259 aa  267  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  61.65 
 
 
248 aa  262  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1409  flagellar biosynthesis protein FliP  66.14 
 
 
255 aa  261  4.999999999999999e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.515984  normal  0.98603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  63.51 
 
 
221 aa  261  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  60.53 
 
 
254 aa  260  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  59.52 
 
 
260 aa  259  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  64.45 
 
 
223 aa  258  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  56.94 
 
 
231 aa  258  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  56.19 
 
 
244 aa  255  5e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  59.91 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  56.19 
 
 
244 aa  252  3e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  60.1 
 
 
251 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  55.71 
 
 
244 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  58.96 
 
 
260 aa  251  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  59.61 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  54.91 
 
 
266 aa  249  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0066  flagellar biosynthetic protein FliP  60.87 
 
 
213 aa  249  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  60.1 
 
 
254 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  55.24 
 
 
244 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
254 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  58.62 
 
 
234 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  59.31 
 
 
254 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  58.17 
 
 
250 aa  245  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  56.4 
 
 
238 aa  245  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  57.21 
 
 
248 aa  244  4.9999999999999997e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  58.33 
 
 
255 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5301  flagellar biosynthesis protein FliP  59.51 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.514548  normal  0.0599925 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  54.03 
 
 
244 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  61.38 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  56.81 
 
 
261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  55.02 
 
 
247 aa  241  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  52.13 
 
 
245 aa  240  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  55.87 
 
 
252 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1355  flagellar biosynthesis protein FliP  60.32 
 
 
262 aa  239  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5881  flagellar biosynthesis protein FliP  58.54 
 
 
265 aa  238  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  57.14 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  57.21 
 
 
250 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  57.21 
 
 
250 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  56.34 
 
 
255 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0375  flagellar biosynthesis protein FliP  58.65 
 
 
249 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  55.67 
 
 
251 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  56.25 
 
 
254 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  55.87 
 
 
255 aa  235  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1406  flagellar biosynthetic protein FliP  60.09 
 
 
272 aa  235  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  50.92 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  55.67 
 
 
283 aa  234  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0560  flagellar biosynthesis protein FliP  57.08 
 
 
260 aa  234  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.39215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1026  flagellar biosynthesis protein FliP  58.05 
 
 
262 aa  234  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 
248 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 
248 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  54.11 
 
 
255 aa  234  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 
248 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  54.59 
 
 
248 aa  234  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2699  flagellar biosynthetic protein FliP  56.04 
 
 
281 aa  234  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00986779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  54.15 
 
 
287 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  56.73 
 
 
255 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  50.92 
 
 
289 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1566  flagellar biosynthetic protein FliP  55.29 
 
 
258 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3680  flagellar biosynthesis protein FliP  58.91 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.64815  normal  0.849421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  55.12 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4757  flagellar biosynthesis protein FliP  58.91 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  0.910166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  52.38 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  56.25 
 
 
251 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  55.29 
 
 
280 aa  232  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  56.44 
 
 
251 aa  232  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  56.1 
 
 
262 aa  232  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1965  flagellar biosynthesis protein FliP  58.73 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  52.75 
 
 
299 aa  231  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  52.17 
 
 
248 aa  231  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  55.61 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  56.59 
 
 
253 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  56.59 
 
 
253 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 
253 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 
253 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  56.31 
 
 
253 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  51.9 
 
 
247 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  52.11 
 
 
255 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0763  flagellar biosynthesis protein FliP  60.19 
 
 
248 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.49516  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  56.59 
 
 
276 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  52.61 
 
 
246 aa  229  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0032  flagellar biosynthesis protein FliP  56.59 
 
 
276 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
293 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0575  flagellar biosynthesis protein FliP  56.1 
 
 
254 aa  229  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  53.62 
 
 
249 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0040  flagellar biosynthesis protein FliP  57.07 
 
 
253 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>