50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1791 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1791  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 168 aa  347  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  48.08 
 
 		 423 aa  58.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  45.33 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  32.04 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.02 
 
 		 1089 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 319 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.37 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.57 
 
 		 864 aa  48.9  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  50 
 
 		 554 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.35 
 
 		 422 aa  48.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 322 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.65 
 
 		 974 aa  47.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5194  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00951194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  30.53 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  38.67 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 306 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  41.67 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  39.62 
 
 		 406 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  37.04 
 
 		 409 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 294 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.29 
 
 		 391 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4396  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 313 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000949071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.48 
 
 		 433 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.78 
 
 		 266 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 300 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.98 
 
 		 283 aa  44.3  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  36.36 
 
 		 280 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 334 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5403  cell wall hydrolase/autolysin  33.33 
 
 		 383 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  35.59 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3571  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.74 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4538  cell wall hydrolase/autolysin  34.92 
 
 		 438 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0330  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.56 
 
 		 792 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.11 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  35.29 
 
 		 378 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0669  peptidoglycan binding domain-containing protein  38 
 
 		 465 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.65 
 
 		 201 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 508 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  42.86 
 
 		 462 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4768  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.74 
 
 		 245 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 256 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2115  SCP-like extracellular  51.43 
 
 		 349 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.147298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  40.32 
 
 		 225 aa  41.2  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2412  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 1557 aa  41.2  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 635 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 398 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 398 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 398 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  35.85 
 
 		 395 aa  40.8  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>