More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2415 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  100 
 
 
219 aa  441  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  58.02 
 
 
223 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  60.7 
 
 
223 aa  252  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  51.01 
 
 
270 aa  203  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  51.87 
 
 
270 aa  201  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  52.75 
 
 
266 aa  201  7e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  50.79 
 
 
204 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  52.91 
 
 
252 aa  187  7e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  45.97 
 
 
240 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  48.68 
 
 
202 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  48.44 
 
 
226 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  50.29 
 
 
201 aa  175  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  50.29 
 
 
204 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.63 
 
 
226 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  47.74 
 
 
213 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  53.18 
 
 
240 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  50.29 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  44.55 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  44.55 
 
 
241 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  50.29 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  49.13 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  40.76 
 
 
239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  48.66 
 
 
198 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  51.45 
 
 
257 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0074  GDSL family lipase  48.86 
 
 
234 aa  167  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  41.04 
 
 
222 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  46.63 
 
 
214 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  46.63 
 
 
213 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  43.63 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  47.03 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  50.29 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  47.03 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  45.11 
 
 
216 aa  161  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  49.71 
 
 
227 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  44.38 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6500  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 
237 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  44.72 
 
 
255 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.39 
 
 
227 aa  151  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  42.25 
 
 
209 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  44.38 
 
 
201 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  44.27 
 
 
208 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  46.93 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  38.73 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  43.58 
 
 
201 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  38.24 
 
 
208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  43.02 
 
 
201 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  40.78 
 
 
214 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  44.07 
 
 
217 aa  143  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  43.02 
 
 
214 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  43.02 
 
 
201 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  39.66 
 
 
209 aa  141  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  42.46 
 
 
199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  42.94 
 
 
201 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  40.46 
 
 
210 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  38.5 
 
 
211 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  41.04 
 
 
255 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0010  Arylesterase  43.43 
 
 
228 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.939172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  41.24 
 
 
219 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  38.69 
 
 
223 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  39.55 
 
 
213 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  42.53 
 
 
205 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  38.42 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  39.34 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3444  arylesterase  42.2 
 
 
214 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  42.86 
 
 
201 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  43.9 
 
 
201 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  40.21 
 
 
208 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  38.55 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  43.02 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  39.05 
 
 
202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  43.02 
 
 
202 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  36.9 
 
 
206 aa  132  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2242  Arylesterase  45.2 
 
 
200 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0186506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  43.9 
 
 
201 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  42.44 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  37.7 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  38.51 
 
 
255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.74 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  37.89 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23070  Arylesterase protein  43.5 
 
 
198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803817  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  38.62 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  36.52 
 
 
200 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  35.33 
 
 
198 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  39.43 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  41.86 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.43 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.43 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.43 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.43 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.43 
 
 
208 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  39.43 
 
 
208 aa  128  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  39.43 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.97 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  35.65 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  41.67 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05801  arylesterase  35.96 
 
 
200 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  41.86 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  41.86 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  34.59 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  38.25 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>