257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0239 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  72.18 
 
 		 172 aa  201  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  58.99 
 
 		 140 aa  175  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  52.9 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 138 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  33.33 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  32.31 
 
 		 144 aa  76.6  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  30.6 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.8 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  32.28 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.36 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.7 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.61 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  37.17 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.95 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.95 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  33.85 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  29.41 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  26.96 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  43.06 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  28.12 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  29.23 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  27.35 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  27.35 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  25.4 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 149 aa  62  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.54 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.51 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.12 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.07 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  29.01 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  29.09 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  23.26 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>