23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2961 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2961  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 635 aa  1245    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.445649 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1322  TPR repeat-containing protein  88.07 
 
 		 627 aa  1000    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.993956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2071  TPR repeat-containing protein  60 
 
 		 757 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1698  TPR domain-containing protein  50.5 
 
 		 626 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1635  TPR repeat-containing protein  48.5 
 
 		 665 aa  204  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0192476  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 611 aa  189  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1260  TPR repeat-containing protein  43.58 
 
 		 616 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.126899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1302  TPR domain-containing protein  42.6 
 
 		 846 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  38.34 
 
 		 974 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.17 
 
 		 883 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 878 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 893 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 900 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1443  hypothetical protein  27.35 
 
 		 460 aa  50.8  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 311 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 436 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1091 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 1737 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.83 
 
 		 340 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1125  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 457 aa  45.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  39.44 
 
 		 587 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 288 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 423 aa  43.9  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>