More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2794 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  784    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  97.44 
 
 		 391 aa  769    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  76.73 
 
 		 391 aa  617  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  68.54 
 
 		 391 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  69.41 
 
 		 392 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  67.52 
 
 		 391 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  66.24 
 
 		 391 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  67.01 
 
 		 391 aa  529  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  66.24 
 
 		 391 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.68 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 		 393 aa  391  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  51.16 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  51.8 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.16 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.61 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  51.16 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 396 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  52.45 
 
 		 416 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  51.93 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  49.62 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  49.36 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 		 391 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.67 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  50.13 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 396 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  50 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 396 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  48.72 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0278  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000883017  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  48.59 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 393 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  46.65 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3781  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.338969  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>