40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6578 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6578  abortive infection protein  100 
 
 
286 aa  548  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0258  abortive infection protein  75.47 
 
 
272 aa  301  9e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.750213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3509  abortive infection protein  58.15 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.585931  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1205  Abortive infection protein  56.8 
 
 
258 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.69996  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0933  abortive infection protein  57.72 
 
 
296 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.160537  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1424  Abortive infection protein  53.85 
 
 
273 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4542  abortive infection protein  51.64 
 
 
256 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.651629  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4120  abortive infection protein  52.46 
 
 
256 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1376  hypothetical protein  51.85 
 
 
437 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0085  Abortive infection protein  48.85 
 
 
264 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3452  Abortive infection protein  46.55 
 
 
282 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4773  Abortive infection protein  49.79 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1143  abortive infection protein  49.19 
 
 
256 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151546  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2503  Abortive infection protein  46.91 
 
 
263 aa  194  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0727648  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36220  CAAX amino terminal protease family  46.51 
 
 
269 aa  191  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.731367  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5664  abortive infection protein  48.57 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25622  normal  0.0200429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01000  CAAX amino terminal protease family  56.4 
 
 
241 aa  187  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0216  Abortive infection protein  45.31 
 
 
277 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3260  Abortive infection protein  44.09 
 
 
293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3716  abortive infection protein  45.16 
 
 
257 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393997  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2806  abortive infection protein  45.16 
 
 
264 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5417  abortive infection protein  47.76 
 
 
259 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.667747 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1358  Abortive infection protein  41.3 
 
 
260 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000453852 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1315  abortive infection protein  43.8 
 
 
255 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5124  abortive infection protein  47.76 
 
 
259 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5036  abortive infection protein  47.76 
 
 
259 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120266  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5658  abortive infection protein  45.16 
 
 
268 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5401  abortive infection protein  45.16 
 
 
268 aa  165  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.459876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25550  CAAX amino terminal protease family  46.28 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4030  Abortive infection protein  49.57 
 
 
242 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04670  CAAX amino terminal protease family  41.39 
 
 
302 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.767704  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0173  Abortive infection protein  44.4 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.559732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0137  Abortive infection protein  42.57 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06020  hypothetical protein  38.95 
 
 
295 aa  136  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.334826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4016  hypothetical protein  35.11 
 
 
360 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.905588  normal  0.0158572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  30.11 
 
 
242 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1943  abortive infection protein  31.52 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.142056  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2139  abortive infection protein  36.78 
 
 
210 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.317172  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  29.19 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1534  Abortive infection protein  33.67 
 
 
120 aa  42.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.257594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>