More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4953 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4953  ABC transporter related  100 
 
 		 683 aa  1307    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2983  ABC transporter related  64.17 
 
 		 653 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7440  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 620 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4037  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 591 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.073685  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1772  hypothetical protein  42.76 
 
 		 575 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.100402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0007  ABC transporter related protein  48.12 
 
 		 588 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.78 
 
 		 626 aa  350  5e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3109  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 590 aa  349  8e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.516778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2498  ABC transporter related  44.36 
 
 		 595 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3689  ABC transporter related  39.35 
 
 		 637 aa  343  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  33.67 
 
 		 583 aa  333  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  33.04 
 
 		 586 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 586 aa  323  8e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.16 
 
 		 586 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.98 
 
 		 586 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 586 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1142  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  41.09 
 
 		 578 aa  318  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.98 
 
 		 586 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 586 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.86 
 
 		 586 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3351  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 616 aa  313  9e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3667  ABC transporter related  40.28 
 
 		 617 aa  306  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0908626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2777  ABC transporter related  36.21 
 
 		 608 aa  300  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.784586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4862  ABC transporter related  39.72 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1968  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 619 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  31.28 
 
 		 573 aa  286  7e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0093  ABC transporter related protein  36.66 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.72 
 
 		 632 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.97 
 
 		 587 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  30.87 
 
 		 617 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 		 639 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 		 627 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.04 
 
 		 650 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.98 
 
 		 608 aa  275  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3544  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.51 
 
 		 629 aa  274  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.48 
 
 		 575 aa  273  6e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 598 aa  273  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.18 
 
 		 641 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5093  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 597 aa  273  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.390204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.64 
 
 		 566 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  33.57 
 
 		 634 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.58 
 
 		 640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  33.46 
 
 		 666 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3151  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.89 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  34.49 
 
 		 672 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.71 
 
 		 634 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.83 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.21 
 
 		 600 aa  268  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.05 
 
 		 548 aa  267  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  31.78 
 
 		 603 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.92 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  33.67 
 
 		 649 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 600 aa  264  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.15 
 
 		 580 aa  264  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.27 
 
 		 603 aa  263  6e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  34.74 
 
 		 567 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.47 
 
 		 597 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.33 
 
 		 567 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.92 
 
 		 672 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  28.99 
 
 		 575 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1512  ABC transporter related  35.16 
 
 		 611 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00861332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  28.99 
 
 		 575 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  28.8 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.98 
 
 		 567 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  32.42 
 
 		 811 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.05 
 
 		 613 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3884  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.26 
 
 		 597 aa  260  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.39 
 
 		 669 aa  260  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.09 
 
 		 636 aa  260  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  27.3 
 
 		 597 aa  260  7e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  27.3 
 
 		 597 aa  260  8e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  27.3 
 
 		 628 aa  259  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.36 
 
 		 572 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.18 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  29.25 
 
 		 671 aa  258  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  30 
 
 		 607 aa  258  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.44 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.54 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  27.59 
 
 		 619 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.7 
 
 		 702 aa  257  6e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  33.94 
 
 		 594 aa  257  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2515  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.16 
 
 		 587 aa  256  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.47 
 
 		 605 aa  256  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.81 
 
 		 677 aa  256  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.62 
 
 		 600 aa  256  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  33.64 
 
 		 663 aa  256  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.83 
 
 		 721 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  32.18 
 
 		 584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3237  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.98 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0279116 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02052  ABC multidrug transporter (Eurofung)  29.17 
 
 		 782 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 691 aa  255  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  34.59 
 
 		 652 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.94 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  29.93 
 
 		 556 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 585 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.01 
 
 		 602 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4441  ABC transporter, transmembrane region  33.53 
 
 		 642 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3493  ABC transporter related  34 
 
 		 594 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.68417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.66 
 
 		 590 aa  253  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>