More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3381 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3381  luciferase family protein  100 
 
 
337 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2659  luciferase-like  42.5 
 
 
327 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0969127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2329  Luciferase-like monooxygenase  42.14 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0213  putative F420-dependent oxidoreductase  40.53 
 
 
336 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2517  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.25 
 
 
304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0173  putative F420-dependent oxidoreductase  38.39 
 
 
326 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2418  Luciferase-like monooxygenase  37.96 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00430888  hitchhiker  0.005997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0516  luciferase family protein  36.61 
 
 
327 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6911  luciferase family protein  35.74 
 
 
325 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3259  luciferase family protein  33.93 
 
 
350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0757  luciferase family protein  34.87 
 
 
310 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  0.787392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12907  oxidoreductase  33.1 
 
 
325 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000227121  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1139  putative F420-dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0205  luciferase family protein  28.03 
 
 
316 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122273  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3123  Luciferase-like monooxygenase  32.3 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3873  putative F420-dependent oxidoreductase  36.52 
 
 
343 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0154742  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0791  Luciferase-like monooxygenase  30.09 
 
 
307 aa  119  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.393824  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1977  Luciferase-like monooxygenase  41.18 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39070  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.33 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1815  luciferase family protein  31.35 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0629  luciferase family protein  38.37 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0662642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1675  luciferase family protein  37.79 
 
 
311 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1269  Luciferase-like monooxygenase  40.71 
 
 
290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213447  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3231  putative F420-dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
324 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5695  luciferase family protein  34.17 
 
 
286 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.146497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0268  luciferase family protein  36.61 
 
 
313 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3910  putative F420-dependent oxidoreductase  35.98 
 
 
314 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1594  putative F420-dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
309 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  37.5 
 
 
310 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1948  luciferase-like protein  35.79 
 
 
353 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.38 
 
 
311 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6754  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.42 
 
 
310 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4930  luciferase family protein  30.72 
 
 
274 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0362878  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0395  Luciferase-like monooxygenase  34.92 
 
 
306 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.104379  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2280  luciferase-like monooxygenase  33.82 
 
 
305 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101166  normal  0.0450195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1696  luciferase family protein  35.39 
 
 
330 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3738  luciferase-like  35.08 
 
 
294 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.945207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5063  luciferase-like protein  38.78 
 
 
285 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8280  Luciferase-like monooxygenase  37.42 
 
 
281 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455932  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5151  luciferase family protein  38.78 
 
 
285 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5442  luciferase family protein  38.78 
 
 
285 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.942961  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1117  luciferase family protein  32.66 
 
 
287 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.30712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0998  luciferase family protein  32.69 
 
 
290 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0451  luciferase-like protein  34.71 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10807  hypothetical protein  42.31 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000229169  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0462  luciferase family protein  36.25 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0438  luciferase family protein  34.71 
 
 
309 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.465558  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4098  luciferase family protein  35.71 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207864  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  34.29 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  31.18 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2603  putative F420-dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.52821  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0211  luciferase-like protein  31.67 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4671  Luciferase-like monooxygenase  39.72 
 
 
287 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.444126  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4489  luciferase-like protein  28.09 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4576  luciferase family protein  28.09 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.149021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4872  luciferase family protein  28.09 
 
 
338 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.0985833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29280  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.76 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.963848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  31.88 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11883  oxidoreductase  34.13 
 
 
307 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3880  luciferase family protein  34.91 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1926  hypothetical protein  32.83 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2430  putative F420-dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.590177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5062  luciferase family protein  32.54 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0803  putative F420-dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3286  luciferase family protein  30.69 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  32.28 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2274  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
326 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.800632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0704  luciferase family protein  33.52 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0169592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5600  luciferase-like protein  31.22 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2491  luciferase family protein  32.56 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  normal  0.915237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4097  luciferase family protein  36.29 
 
 
306 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.607989  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3320  luciferase family protein  36.96 
 
 
338 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12590  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.99 
 
 
292 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.623605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2032  luciferase-like protein  37.4 
 
 
308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2313  luciferase family protein  31.41 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0072758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4265  putative F420-dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
288 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2078  luciferase family protein  37.4 
 
 
308 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5013  Luciferase-like monooxygenase  31.73 
 
 
288 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2098  luciferase family protein  31.35 
 
 
309 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.463112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4271  luciferase family protein  33.73 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0653657  normal  0.0110143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04560  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.02 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.36075  normal  0.0961498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3697  putative F420-dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1207  putative F420-dependent oxidoreductase  31.52 
 
 
327 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.814029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3765  luciferase-like  33.97 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2248  luciferase family protein  30.6 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  34.83 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4065  Luciferase-like monooxygenase  32.5 
 
 
290 aa  89.4  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.247001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  33.73 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0981  Luciferase-like monooxygenase  29.71 
 
 
332 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4069  luciferase-like protein  31.88 
 
 
339 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3077  luciferase family protein  31.55 
 
 
309 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0882  luciferase family protein  31.03 
 
 
300 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.986005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1330  Luciferase-like monooxygenase  29.12 
 
 
323 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0876  luciferase-like protein  31.71 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4374  luciferase-like protein  31.03 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0893  luciferase family protein  31.71 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4461  luciferase family protein  31.03 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0432852  normal  0.0185115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5167  luciferase family protein  35.1 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2015  luciferase family protein  36.29 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.512168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>