31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3151 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3151  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3189  hypothetical protein  56.9 
 
 		 435 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3247  hypothetical protein  54.4 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4659  glycoside hydrolase family protein  53.98 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1779  hypothetical protein  34.78 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2114  extracellular ligand-binding receptor  33.91 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0375175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3442  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  27.74 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  33.68 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2791  Extracellular ligand-binding receptor  34.07 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  0.125183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2831  substrate-binding protein, putative  29.17 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00332473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  29.41 
 
 		 438 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  22.94 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  30.84 
 
 		 519 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5580  hypothetical protein  29.03 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.647703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 378 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  35.59 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  40.7 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  34.09 
 
 		 406 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2025  hypothetical protein  25.99 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0203629  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4823  extracellular ligand-binding receptor  32.04 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.615465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22980  amino acid-binding protein  24.42 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0512293  normal  0.104714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  32.97 
 
 		 541 aa  43.1  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1952  hypothetical protein  27.97 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.542159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>