222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2257 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2257  putative transmembrane cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  100 
 
 
617 aa  1247    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  32.39 
 
 
635 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3671  putative cellulose synthase protein  32.84 
 
 
618 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484697  hitchhiker  0.0086159 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0544  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 
614 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374359  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3766  glycosyltransferase  32.64 
 
 
880 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.028255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4415  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.79 
 
 
616 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.72 
 
 
886 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0158  cellulose synthase-like protein  35.48 
 
 
627 aa  230  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1792  cellulose synthase-like protein  35.63 
 
 
627 aa  230  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337957  normal  0.643203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4003  putative cellulose synthase protein  33.15 
 
 
622 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1333  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.96 
 
 
627 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4332  putative cellulose synthase protein  32.1 
 
 
622 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00407382  hitchhiker  0.00579604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  32.82 
 
 
888 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3905  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.96 
 
 
570 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.504805  normal  0.221865 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
1231 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.44 
 
 
980 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 
620 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.24 
 
 
544 aa  125  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.01 
 
 
586 aa  124  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
591 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  30.89 
 
 
716 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.42 
 
 
712 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
1129 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  23.45 
 
 
737 aa  103  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
1140 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 
1140 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
1140 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  24.73 
 
 
741 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.05 
 
 
822 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3450  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.99 
 
 
659 aa  94  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1116  cellulose synthase (UDP-forming)  31.22 
 
 
691 aa  94  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.772245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.18 
 
 
930 aa  93.6  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  24.29 
 
 
909 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  27.41 
 
 
778 aa  93.6  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.63 
 
 
831 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
650 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3768  cellulose synthase (UDP-forming)  29.46 
 
 
677 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.092957  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  23.72 
 
 
699 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  24.27 
 
 
564 aa  90.5  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  24.69 
 
 
788 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  23.47 
 
 
845 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.63 
 
 
834 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  24.69 
 
 
788 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  23.17 
 
 
501 aa  88.6  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.84 
 
 
846 aa  88.2  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
659 aa  88.2  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 
848 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 
846 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.52 
 
 
845 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 
848 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.81 
 
 
804 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  23.58 
 
 
547 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.88 
 
 
848 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  24.63 
 
 
846 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 
579 aa  85.1  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
857 aa  84.7  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  22.33 
 
 
845 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  25.69 
 
 
683 aa  83.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.8 
 
 
702 aa  83.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.98 
 
 
749 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.33 
 
 
845 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  22.65 
 
 
729 aa  83.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  25.53 
 
 
658 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
514 aa  82.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  27.52 
 
 
848 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.24 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.06 
 
 
811 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  26.02 
 
 
1455 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0406  cellulose synthase (UDP-forming)  31.11 
 
 
658 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0415  cellulose synthase (UDP-forming)  31.11 
 
 
658 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.269998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0394  cellulose synthase (UDP-forming)  31.11 
 
 
658 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193019  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.8 
 
 
810 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.67 
 
 
794 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2615  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.96 
 
 
641 aa  80.9  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
658 aa  80.9  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  24.84 
 
 
845 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  24.84 
 
 
845 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1828  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.26 
 
 
656 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  24.94 
 
 
707 aa  80.1  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.65 
 
 
768 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  24.17 
 
 
652 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  26.03 
 
 
624 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  25.38 
 
 
867 aa  78.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  22.4 
 
 
726 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  24.63 
 
 
788 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  22.85 
 
 
740 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
773 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  21.2 
 
 
718 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  24.52 
 
 
845 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.59 
 
 
652 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0281  cellulose synthase (UDP-forming)  30.73 
 
 
314 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  24.94 
 
 
758 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.15 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  25.23 
 
 
874 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  25.23 
 
 
874 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
905 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  22.5 
 
 
696 aa  75.5  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  25.23 
 
 
874 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.53 
 
 
652 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  24.47 
 
 
872 aa  75.1  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>