55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2146 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2146  reverse transcriptase  100 
 
 		 134 aa  280  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  55.22 
 
 		 415 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  54.55 
 
 		 411 aa  160  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2554  reverse transcriptase  51.49 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1001  reverse transcriptase  48.51 
 
 		 251 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3730  RNA-directed DNA polymerase  48.51 
 
 		 340 aa  138  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.70483 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1481  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.97 
 
 		 418 aa  138  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.251743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0275  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.41 
 
 		 354 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6736  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.76 
 
 		 417 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3413  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.76 
 
 		 417 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2104  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  46.09 
 
 		 413 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0282857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4539  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.85 
 
 		 413 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  42.42 
 
 		 413 aa  123  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.74 
 
 		 350 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.951259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1979  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.74 
 
 		 417 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.312745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0653  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.74 
 
 		 417 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.008692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4903  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.79 
 
 		 419 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.79 
 
 		 419 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0131896  normal  0.0593975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5513  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.79 
 
 		 419 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6095  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.79 
 
 		 419 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  40.3 
 
 		 441 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2197  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.93 
 
 		 440 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0056  reverse transcriptase  37.3 
 
 		 405 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0032  hypothetical protein  37.3 
 
 		 256 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.21 
 
 		 607 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.21 
 
 		 607 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.21 
 
 		 607 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.21 
 
 		 607 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1369  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30 
 
 		 487 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2879  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30 
 
 		 487 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2930  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30 
 
 		 487 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3066  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30 
 
 		 487 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1245  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.89 
 
 		 427 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  31.93 
 
 		 488 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  31.53 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0690  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.87 
 
 		 429 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3822  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.87 
 
 		 429 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.424359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2250  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.87 
 
 		 429 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461169  normal  0.551741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.63 
 
 		 502 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0230  reverse transcriptase  50 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2318  RNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 425 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.0142975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  30.1 
 
 		 439 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3886  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.76 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2627  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.17 
 
 		 493 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.332645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4340  RNA-directed DNA polymerase  26.21 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00199166  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1127  RNA-directed DNA polymerase  24.8 
 
 		 449 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0764  RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)  27.73 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0622  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.93 
 
 		 603 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000352823  hitchhiker  0.00000108768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1070  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.93 
 
 		 603 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.229974  normal  0.255999 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0086  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  26.67 
 
 		 493 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.03 
 
 		 434 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.70829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>