More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0231 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0231  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
393 aa  783    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208592  normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4354  chaperone DnaJ-like  81.27 
 
 
396 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  56.74 
 
 
387 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0527  chaperone protein DnaJ  52.09 
 
 
396 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0114  chaperone protein DnaJ  51.51 
 
 
391 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000234642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0115  chaperone protein DnaJ  51 
 
 
390 aa  360  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  52.93 
 
 
383 aa  359  5e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  52.03 
 
 
374 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0236  chaperone protein DnaJ  51.41 
 
 
380 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0198  chaperone protein DnaJ  50.51 
 
 
404 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0132968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4268  chaperone protein DnaJ  51.02 
 
 
400 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.380859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38560  chaperone protein DnaJ  50 
 
 
387 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0413563  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1962  chaperone protein DnaJ  48.95 
 
 
361 aa  324  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0364  chaperone protein DnaJ  47.7 
 
 
389 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154064  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10357  chaperone protein DnaJ  52.2 
 
 
395 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0119746  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0475  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0451  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.474752  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0464  chaperone protein DnaJ  52.21 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0258  chaperone protein DnaJ  48.31 
 
 
394 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411969  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0636  chaperone protein DnaJ  49.59 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37318  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  45.62 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4361  chaperone protein DnaJ  46.25 
 
 
396 aa  273  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  41.69 
 
 
374 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  41.44 
 
 
373 aa  265  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  39.06 
 
 
385 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  39.23 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  38.58 
 
 
381 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  39.15 
 
 
376 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0800  chaperone protein DnaJ  40.55 
 
 
378 aa  261  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  39.02 
 
 
372 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  39.15 
 
 
376 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  40.48 
 
 
375 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  40.26 
 
 
376 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 
376 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 
376 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 
376 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  39.15 
 
 
376 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  40.41 
 
 
379 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  38.95 
 
 
376 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3187  chaperone protein DnaJ  38.58 
 
 
385 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.117357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  40.98 
 
 
382 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  260  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  39.62 
 
 
378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  38.62 
 
 
382 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  37.56 
 
 
387 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  39.35 
 
 
378 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2961  chaperone protein DnaJ  38.58 
 
 
385 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2956  chaperone protein DnaJ  37.95 
 
 
382 aa  258  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  38.62 
 
 
376 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  41.42 
 
 
375 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
377 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  38.36 
 
 
382 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  39.52 
 
 
389 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  40.1 
 
 
369 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  36.27 
 
 
382 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  38.03 
 
 
374 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  38.1 
 
 
377 aa  255  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  39.73 
 
 
374 aa  255  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  41.19 
 
 
401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6930  chaperone protein DnaJ  38.42 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  40.93 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  37.86 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0579  chaperone protein DnaJ  37.87 
 
 
382 aa  253  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3920  chaperone protein DnaJ  37.24 
 
 
380 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0757957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0009  chaperone protein DnaJ  39.68 
 
 
385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111301  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  40.45 
 
 
374 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  39.28 
 
 
379 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3143  chaperone protein DnaJ  38.27 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
377 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  39.78 
 
 
375 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  40.9 
 
 
372 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  38.5 
 
 
377 aa  252  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2310  chaperone protein DnaJ  38.42 
 
 
381 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  37.17 
 
 
378 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  38.01 
 
 
379 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  38.01 
 
 
379 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  38.01 
 
 
379 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  37.31 
 
 
377 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  38.61 
 
 
380 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0308  chaperone protein DnaJ  38.27 
 
 
380 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  37.9 
 
 
375 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0034  chaperone protein DnaJ  40.43 
 
 
373 aa  249  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  37.6 
 
 
376 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  37.97 
 
 
377 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1309  chaperone protein DnaJ  37.24 
 
 
376 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  37.14 
 
 
375 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5469  chaperone protein DnaJ  49.6 
 
 
387 aa  249  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  37.56 
 
 
379 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  37.92 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  37.43 
 
 
379 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  37.92 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  37.27 
 
 
379 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  37.92 
 
 
376 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  37.47 
 
 
380 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>