137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1746 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1746  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0533978  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3423  putative transposase  58.43 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4771  putative transposase  53.85 
 
 		 282 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  54.9 
 
 		 583 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3419  putative transposase  54.9 
 
 		 211 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.963439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2179  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2878  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318779  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2956  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3003  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3580  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.364035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5590  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.64071  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7093  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 363 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  45.88 
 
 		 370 aa  74.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3895  putative transposase  45.88 
 
 		 364 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4085  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508946  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4262  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.234928  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0871  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1627  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.857039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1628  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2447  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2516  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2834  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.996081  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3168  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  45.88 
 
 		 364 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.555187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  50.65 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  39.24 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  39.24 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  39.24 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  39.24 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  39.24 
 
 		 357 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  43.9 
 
 		 359 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3014  hypothetical protein  45 
 
 		 311 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  46.75 
 
 		 361 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  46.75 
 
 		 361 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  42.35 
 
 		 366 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8042  transcriptional regulator AraC family  43.59 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  43.37 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  51.56 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  46.15 
 
 		 362 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  42.68 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5010  aminoglycoside phosphotransferase  51.61 
 
 		 626 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4553  putative transposase  51.61 
 
 		 363 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  40 
 
 		 346 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  43.42 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  41.03 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  42.86 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2523  putative transposase  39.51 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4122  putative transposase  44.44 
 
 		 370 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758649  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4131  putative transposase  44.44 
 
 		 370 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4235  putative transposase  44.44 
 
 		 367 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.14666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4600  feruloyl esterase  44.44 
 
 		 367 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0809  putative transposase  44.44 
 
 		 370 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.290727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  43.59 
 
 		 379 aa  53.5  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1402  putative transposase  39.51 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  39.51 
 
 		 351 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4503  hypothetical protein  39.51 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  40.96 
 
 		 389 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  40.96 
 
 		 362 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  40.96 
 
 		 362 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  40.96 
 
 		 362 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5740  integrase, catalytic region  34.94 
 
 		 356 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  34.15 
 
 		 363 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  34.15 
 
 		 363 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  34.15 
 
 		 363 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  34.15 
 
 		 363 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  38.46 
 
 		 364 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  34.15 
 
 		 363 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4792  feruloyl esterase  45.83 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5940  feruloyl esterase  45.83 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0473379 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6166  feruloyl esterase  45.83 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6453  feruloyl esterase  45.83 
 
 		 340 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6477  feruloyl esterase  45.83 
 
 		 362 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  34.15 
 
 		 363 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8202  transposase  39.24 
 
 		 366 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  39.24 
 
 		 365 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0041  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279353  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0090  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0548  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00428221  normal  0.756341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4072  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4135  integrase catalytic subunit  43.55 
 
 		 359 aa  50.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.300606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3360  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 353 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  37.04 
 
 		 363 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  37.04 
 
 		 363 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  37.04 
 
 		 363 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2149  putative transposase  43.55 
 
 		 363 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123285 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0513  transposase  37.97 
 
 		 287 aa  50.1  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3196  putative transposase  38.27 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2633  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.175768  normal  0.271713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3858  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4886  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.335195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2222  ISRSO5-transposase protein  41.77 
 
 		 375 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>