More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1449 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1449  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
362 aa  712    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0465334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5066  alcohol dehydrogenase  83.67 
 
 
366 aa  584  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0364575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2396  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  72.5 
 
 
361 aa  521  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.516126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2454  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  73.89 
 
 
361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000626099  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4165  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.56 
 
 
361 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356272  normal  0.0548986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3767  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  71.15 
 
 
361 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836579  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1403  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.83 
 
 
361 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0304986  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3651  alcohol dehydrogenase  71.15 
 
 
365 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2902  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.72 
 
 
361 aa  501  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1329  alcohol dehydrogenase class 3  73.74 
 
 
361 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3472  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.97 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  67.87 
 
 
362 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  67.87 
 
 
362 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.91 
 
 
362 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  67.87 
 
 
362 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03740  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  70.31 
 
 
363 aa  487  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  68.61 
 
 
361 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1341  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.22 
 
 
361 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.600384  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  68.25 
 
 
361 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2885  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  69.44 
 
 
363 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.897584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4761  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  68.61 
 
 
362 aa  480  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3767  alcohol dehydrogenase  67.97 
 
 
361 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  67.39 
 
 
372 aa  474  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2925  alcohol dehydrogenase  67.5 
 
 
361 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10580  Zn-dependent alcohol dehydrogenase, class III  65.29 
 
 
364 aa  471  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.107313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3723  alcohol dehydrogenase  67.83 
 
 
380 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2766  alcohol dehydrogenase  65.47 
 
 
364 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170215  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15330  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  67.67 
 
 
366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  63.64 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  57.82 
 
 
574 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4646  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  61.22 
 
 
366 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.78 
 
 
368 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7131  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1775  putative alcohol dehydrogenase (zinc-binding)  41.9 
 
 
361 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5201  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.78 
 
 
361 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  40.75 
 
 
359 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2600  alcohol dehydrogenase  43.57 
 
 
363 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163819  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3009  alcohol dehydrogenase  37.67 
 
 
361 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.39042  normal  0.310098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0743  alcohol dehydrogenase  37.06 
 
 
366 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0741  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.87 
 
 
370 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2883  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.23 
 
 
383 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5895  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  39.36 
 
 
359 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.500089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2247  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.11 
 
 
364 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3073  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.95 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2799  alcohol dehydrogenase  42.86 
 
 
363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.77 
 
 
381 aa  213  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2307  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
372 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
360 aa  209  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8254  zinc-type alcohol dehydrogenase AdhD (aldehyde reductase)  38.05 
 
 
361 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2889  histidine kinase  32.98 
 
 
368 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834376  hitchhiker  0.00334697 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06925  hypothetical protein  35.68 
 
 
382 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2414  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
369 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1664  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.77 
 
 
360 aa  205  9e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0508801  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3680  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.42 
 
 
372 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.030881  normal  0.148071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0545  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.06 
 
 
365 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114618 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0746  alcohol dehydrogenase class 3  35.41 
 
 
382 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.38906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2251  alcohol dehydrogenase  34.88 
 
 
375 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1540  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
376 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.47275  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3767  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
376 aa  202  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3672  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.5 
 
 
366 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.618419  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1179  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  33.6 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.457911  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0004  alcohol dehydrogenase, zinc-binding  35.23 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0375  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3280  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.43 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000929  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.59 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0920  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  38.46 
 
 
377 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4227  alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2571  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
379 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3011  alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
379 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  0.000974113 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0269  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.92 
 
 
376 aa  199  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2473  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.7 
 
 
379 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1394  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.37 
 
 
370 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0239994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3405  formaldehyde dehydrogenase (glutathione)  35.52 
 
 
372 aa  199  7e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3021  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.92 
 
 
376 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 
369 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6841  alcohol dehydrogenase  39.27 
 
 
358 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4059  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
376 aa  199  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2469  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.36 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.43107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0349  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.81 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1839  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75863  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03331  putative alcohol dehydrogenase  34.41 
 
 
385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2408  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.943982  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5633  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.52 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1938  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2526  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.879983  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2956  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.33 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00985195  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2174  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.43 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2419  alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1940  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.390441  normal  0.834541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1978  alcohol dehydrogenase  38.32 
 
 
367 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.312028  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0985  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  35.79 
 
 
369 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1786  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
379 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2191  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
379 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.934833  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1837  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
379 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.245686 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3679  alcohol dehydrogenase  37.05 
 
 
367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0052  alcohol dehydrogenase class III  33.78 
 
 
376 aa  196  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.657136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  35.22 
 
 
369 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1032  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  34.6 
 
 
384 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1667  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
373 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>