More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4167 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4167  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6082  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  55.98 
 
 
343 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.77 
 
 
346 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3142  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.51 
 
 
346 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3710  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.64 
 
 
346 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  44.54 
 
 
348 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2470  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.38 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  44.06 
 
 
348 aa  288  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3416  alcohol dehydrogenase  49.42 
 
 
347 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0345253  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3405  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  49.42 
 
 
347 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3468  alcohol dehydrogenase  49.42 
 
 
347 aa  276  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173006  normal  0.111034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2810  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.7 
 
 
349 aa  275  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000257608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1489  oxidoreductase  39.42 
 
 
360 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.158427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2363  alcohol dehydrogenase  44.99 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1255  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.83 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.82 
 
 
347 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  38.38 
 
 
350 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.18 
 
 
346 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3627  putative alcohol dehydrogenase  37.19 
 
 
347 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0936  putative alcohol dehydrogenase  36.78 
 
 
347 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3740  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.65 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4413  alcohol dehydrogenase  35.56 
 
 
347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17940  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  37.61 
 
 
356 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0946974  normal  0.969549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
349 aa  194  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
356 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
364 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  36.44 
 
 
364 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 
341 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
341 aa  185  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1750  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34 
 
 
341 aa  185  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.2 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.58 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2641  alcohol dehydrogenase  34.84 
 
 
347 aa  183  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.378512  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2431  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.45 
 
 
344 aa  180  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0758179  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2514  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.396578  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 
350 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1958  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.05 
 
 
353 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0342  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.18 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4551  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.21 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2803  putative NAD-dependent alcohol dehydrogenase  35.54 
 
 
355 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.8 
 
 
350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0543  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  36.65 
 
 
347 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.52 
 
 
350 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1175  alcohol dehydrogenase  35.76 
 
 
346 aa  166  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.518707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.88 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
341 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.72 
 
 
356 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
340 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
344 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67803  secondary alcohol dehydrogenase (SADH2)  33.04 
 
 
336 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8187  alcohol dehydrogenase  33.63 
 
 
349 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
342 aa  156  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
340 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  34.31 
 
 
351 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
350 aa  153  4e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
343 aa  153  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2098  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
350 aa  153  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5545  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
352 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0247  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.33 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3345  alcohol dehydrogenase  35 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.41 
 
 
342 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0843  alcohol dehydrogenase  32.65 
 
 
357 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0310  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.07 
 
 
348 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.9 
 
 
344 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.9 
 
 
344 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.28 
 
 
342 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.99 
 
 
343 aa  149  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
342 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
342 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  32.28 
 
 
344 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.03 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.56 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.72 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.61 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
342 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.84 
 
 
341 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.12 
 
 
341 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.38 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.84 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.53 
 
 
335 aa  145  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  31.42 
 
 
338 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  30.12 
 
 
344 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.83 
 
 
336 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.97 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.97 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
344 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.68 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.68 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.68 
 
 
341 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.68 
 
 
357 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 
340 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  33.03 
 
 
336 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  31.44 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>