40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3232 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  48.71 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  25.45 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1135  universal stress protein  25.86 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00245865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  24.74 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  23.88 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  23.1 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  22.59 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  25 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  20.86 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.57 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.49 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 151 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  27.66 
 
 		 162 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  24.26 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  28.57 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  21.99 
 
 		 152 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  29.32 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  29.32 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  23.23 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  28.57 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  29.32 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  28.57 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  29.32 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  28.57 
 
 		 142 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  25.64 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.82 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  26.28 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  25.32 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  27.82 
 
 		 142 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  19.43 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.39 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  25 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  23.94 
 
 		 144 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  23.24 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  21.23 
 
 		 164 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>