65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3150 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  100 
 
 
700 aa  1425    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  69.91 
 
 
470 aa  324  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  65.9 
 
 
478 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  72.22 
 
 
465 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  55.21 
 
 
479 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  72.77 
 
 
697 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  72.25 
 
 
649 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  67.2 
 
 
394 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  49.06 
 
 
500 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  50.84 
 
 
517 aa  238  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  49.06 
 
 
517 aa  234  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  50.2 
 
 
522 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  45.85 
 
 
497 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  55.03 
 
 
498 aa  217  5e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  47.62 
 
 
521 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  47.62 
 
 
521 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  40.44 
 
 
660 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  43 
 
 
585 aa  175  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  46.28 
 
 
499 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  46.28 
 
 
499 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  45.08 
 
 
724 aa  171  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  45.74 
 
 
544 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  47.85 
 
 
521 aa  164  6e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  37.2 
 
 
512 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  44.56 
 
 
596 aa  163  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  42.79 
 
 
638 aa  163  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  46.52 
 
 
401 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  44.09 
 
 
514 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  43.98 
 
 
522 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  44.92 
 
 
522 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  43.46 
 
 
522 aa  159  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  35.5 
 
 
521 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  44.68 
 
 
518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  44.62 
 
 
509 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  43.68 
 
 
551 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  41.88 
 
 
405 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  45.7 
 
 
405 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  41.97 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  44.44 
 
 
599 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  38.94 
 
 
781 aa  147  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  41.97 
 
 
569 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  42.41 
 
 
821 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  40.8 
 
 
1117 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  40.53 
 
 
514 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  38.62 
 
 
522 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  36.98 
 
 
542 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  37.97 
 
 
802 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  35.6 
 
 
690 aa  120  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  38.17 
 
 
585 aa  120  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  37.04 
 
 
644 aa  115  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  32.56 
 
 
402 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  31.35 
 
 
734 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  33.16 
 
 
686 aa  98.2  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  31.58 
 
 
740 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  30.53 
 
 
740 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  31.5 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  32.28 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  31.5 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  26.42 
 
 
400 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  32.08 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  26.57 
 
 
391 aa  47  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  30 
 
 
392 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  30 
 
 
392 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  29.52 
 
 
392 aa  45.4  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  26.55 
 
 
485 aa  43.9  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>